More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0426 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0426  sensor kinase protein, putative  100 
 
 		 284 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0367403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0232  putative sensor histidine kinase  97.54 
 
 		 282 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22014  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0210  sensor kinase protein  90.85 
 
 		 280 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0244  putative sensor histidine kinase  98.95 
 
 		 286 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2965  putative signal transduction histidine kinase  61.62 
 
 		 271 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3099  putative signal transduction histidine kinase  61.27 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6402  putative signal transduction histidine kinase  62.23 
 
 		 271 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3051  putative signal transduction histidine kinase  61.21 
 
 		 274 aa  278  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3073  putative signal transduction histidine kinase  64.16 
 
 		 271 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3054  putative signal transduction histidine kinase  63.8 
 
 		 271 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.552919  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4346  putative signal transduction histidine kinase  53.9 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0375  putative signal transduction histidine kinase  51.37 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0098  histidine kinase  55.41 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2440  putative signal transduction histidine kinase  65.11 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2956  hypothetical protein  77.5 
 
 		 95 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  36.29 
 
 		 459 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  35.9 
 
 		 464 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  29.72 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 446 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  34.56 
 
 		 461 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 599 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  28.3 
 
 		 391 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 535 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  35.85 
 
 		 470 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  35.16 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 466 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 466 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  33.19 
 
 		 466 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 466 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 466 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 466 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 459 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 485 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.89 
 
 		 373 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  34.76 
 
 		 485 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 468 aa  96.3  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 447 aa  96.3  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  37.55 
 
 		 464 aa  96.3  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 471 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  32.76 
 
 		 466 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  34.56 
 
 		 447 aa  96.3  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 489 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 470 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 479 aa  94.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 363 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  35.58 
 
 		 830 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 370 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 385 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  34.06 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 382 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  34.4 
 
 		 466 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  30.14 
 
 		 392 aa  93.2  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  28.17 
 
 		 379 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 385 aa  92.8  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  34.67 
 
 		 373 aa  92.4  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  31.93 
 
 		 1809 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 1168 aa  92.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  30.25 
 
 		 395 aa  92.4  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 494 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  29.44 
 
 		 391 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 399 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  35.65 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 459 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 459 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 451 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  33.66 
 
 		 439 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  36.15 
 
 		 461 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 552 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 489 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.748441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.91 
 
 		 323 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  34.39 
 
 		 670 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 456 aa  89.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 464 aa  89.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.81 
 
 		 466 aa  89  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 372 aa  89  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  32.09 
 
 		 493 aa  89  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 298 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  33.01 
 
 		 451 aa  89  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  32.93 
 
 		 671 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 748 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3763  Histidine kinase  34.86 
 
 		 394 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.597205  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 469 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  28.91 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 1226 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  33.8 
 
 		 474 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  33.18 
 
 		 799 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 486 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  32.18 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  31.44 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 471 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 475 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  38.1 
 
 		 650 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  33.18 
 
 		 797 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 603 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 490 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 446 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>