More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0232 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0232  putative sensor histidine kinase  100 
 
 
282 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0426  sensor kinase protein, putative  98.94 
 
 
284 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0367403  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0210  sensor kinase protein  91.13 
 
 
280 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0244  putative sensor histidine kinase  97.9 
 
 
286 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2965  putative signal transduction histidine kinase  62.06 
 
 
271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3099  putative signal transduction histidine kinase  61.7 
 
 
271 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6402  putative signal transduction histidine kinase  62.68 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3051  putative signal transduction histidine kinase  61.65 
 
 
274 aa  278  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3073  putative signal transduction histidine kinase  64.62 
 
 
271 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3054  putative signal transduction histidine kinase  64.26 
 
 
271 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.552919  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4346  putative signal transduction histidine kinase  54.29 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0375  putative signal transduction histidine kinase  51.72 
 
 
292 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0098  histidine kinase  55.46 
 
 
288 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2440  putative signal transduction histidine kinase  65.67 
 
 
274 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2956  hypothetical protein  75.83 
 
 
95 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  36.59 
 
 
459 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  29.92 
 
 
388 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  35.44 
 
 
464 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  34.88 
 
 
461 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
446 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
599 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
485 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
446 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
489 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  36.19 
 
 
485 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  28.37 
 
 
391 aa  99  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  35.02 
 
 
293 aa  99  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
479 aa  98.6  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
535 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
370 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  35.85 
 
 
470 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
468 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
382 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  37.87 
 
 
464 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
385 aa  96.3  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
494 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
459 aa  95.9  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  33.19 
 
 
466 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  33.19 
 
 
466 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  33.19 
 
 
466 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.74 
 
 
373 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  33.19 
 
 
466 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  33.19 
 
 
466 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  33.19 
 
 
466 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
394 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
372 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  33.91 
 
 
470 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  34.21 
 
 
298 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  35.05 
 
 
394 aa  92.8  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  35.1 
 
 
830 aa  92.4  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
464 aa  92.4  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  31.78 
 
 
1809 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  32.76 
 
 
466 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  32.84 
 
 
451 aa  92  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
489 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.748441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
1168 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  34.68 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  28.97 
 
 
451 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  35.21 
 
 
474 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
748 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
399 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.1 
 
 
466 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  34.42 
 
 
447 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  34.67 
 
 
373 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
1226 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
447 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  31.51 
 
 
323 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
459 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
459 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  33.99 
 
 
439 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
471 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
385 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  27.38 
 
 
379 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  34.23 
 
 
466 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  32.71 
 
 
493 aa  90.1  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  29.54 
 
 
395 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  33.03 
 
 
797 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  29.38 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  33.03 
 
 
799 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  29.67 
 
 
392 aa  89.4  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  34.7 
 
 
670 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  32.72 
 
 
325 aa  88.6  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  32.79 
 
 
671 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0564  putative signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
383 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
552 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  31.31 
 
 
683 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
541 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  28.97 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  31.58 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  35.94 
 
 
461 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
395 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  30.05 
 
 
456 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  32.02 
 
 
1101 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1538  putative PAS/PAC sensor protein  31.53 
 
 
495 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
366 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
644 aa  86.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
801 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>