More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6402 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6402  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
271 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2965  putative signal transduction histidine kinase  83.76 
 
 
271 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3099  putative signal transduction histidine kinase  82.29 
 
 
271 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3073  putative signal transduction histidine kinase  90.77 
 
 
271 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3054  putative signal transduction histidine kinase  91.14 
 
 
271 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.552919  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2440  putative signal transduction histidine kinase  92.51 
 
 
274 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3051  putative signal transduction histidine kinase  71.53 
 
 
274 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0210  sensor kinase protein  62.41 
 
 
280 aa  271  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0232  putative sensor histidine kinase  62.84 
 
 
282 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0426  sensor kinase protein, putative  62.36 
 
 
284 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0367403  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0244  putative sensor histidine kinase  61.89 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4346  putative signal transduction histidine kinase  51.56 
 
 
288 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0375  putative signal transduction histidine kinase  51.61 
 
 
292 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0098  histidine kinase  56.64 
 
 
288 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  38.5 
 
 
459 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
446 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
446 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  28.76 
 
 
388 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
382 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  33.8 
 
 
461 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
298 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
446 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  34.56 
 
 
313 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  34.58 
 
 
683 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  31.87 
 
 
323 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
535 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
447 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  35.68 
 
 
447 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  33.78 
 
 
439 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  35.53 
 
 
464 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  32.54 
 
 
298 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
552 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
468 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  34.88 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  32.33 
 
 
795 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  35.51 
 
 
466 aa  99.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
464 aa  99.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.75 
 
 
373 aa  98.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  32.26 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  36.57 
 
 
464 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  33.03 
 
 
797 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  32.71 
 
 
1226 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
372 aa  96.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  33.03 
 
 
799 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
795 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
799 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  33.04 
 
 
470 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
795 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
479 aa  95.9  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
1168 aa  95.9  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  32.57 
 
 
493 aa  95.9  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  29.96 
 
 
287 aa  95.5  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
599 aa  95.5  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
373 aa  95.5  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  32.9 
 
 
830 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
373 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
489 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  29.41 
 
 
451 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
401 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
748 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  31.22 
 
 
451 aa  92  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  32 
 
 
459 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
801 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
494 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 
394 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  30.74 
 
 
670 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  29.86 
 
 
456 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
1229 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
485 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
394 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
795 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  28.17 
 
 
392 aa  90.5  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  31.65 
 
 
466 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  37.44 
 
 
485 aa  90.1  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
370 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
485 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
514 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  30.73 
 
 
1101 aa  89.7  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  36.27 
 
 
368 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
385 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  30.08 
 
 
387 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  28.7 
 
 
483 aa  89  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  30.58 
 
 
671 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
490 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  33.63 
 
 
461 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
385 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  32.9 
 
 
458 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.4 
 
 
466 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
363 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  33.5 
 
 
485 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  27.73 
 
 
395 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
784 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
541 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
605 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
475 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  32.44 
 
 
515 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
521 aa  86.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
496 aa  86.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
561 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>