More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4346 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4346  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
288 aa  564  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0375  putative signal transduction histidine kinase  84.98 
 
 
292 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0098  histidine kinase  60.85 
 
 
288 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3051  putative signal transduction histidine kinase  52.6 
 
 
274 aa  252  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2965  putative signal transduction histidine kinase  51.22 
 
 
271 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3099  putative signal transduction histidine kinase  50.17 
 
 
271 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6402  putative signal transduction histidine kinase  52.26 
 
 
271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0210  sensor kinase protein  52.88 
 
 
280 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3073  putative signal transduction histidine kinase  52.08 
 
 
271 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3054  putative signal transduction histidine kinase  52.08 
 
 
271 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.552919  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0232  putative sensor histidine kinase  57.92 
 
 
282 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0426  sensor kinase protein, putative  57.44 
 
 
284 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0367403  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0244  putative sensor histidine kinase  56.97 
 
 
286 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2440  putative signal transduction histidine kinase  56.52 
 
 
274 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  28.98 
 
 
323 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  28.14 
 
 
388 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
479 aa  102  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
801 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
552 aa  99  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  33.97 
 
 
493 aa  98.2  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  35.38 
 
 
461 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
372 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
535 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  35.64 
 
 
394 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
363 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  31.22 
 
 
296 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  33.81 
 
 
466 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1538  putative PAS/PAC sensor protein  30.73 
 
 
495 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  27.55 
 
 
391 aa  93.6  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
385 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  32.31 
 
 
462 aa  92.4  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  34.74 
 
 
470 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
363 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
474 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  32.56 
 
 
797 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
799 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
370 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
382 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  29.53 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  34.82 
 
 
485 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  32.09 
 
 
799 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  32.18 
 
 
464 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  33.05 
 
 
670 aa  89  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  29.28 
 
 
683 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
385 aa  89.4  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  34.48 
 
 
514 aa  89  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  30.42 
 
 
298 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  30.94 
 
 
483 aa  89  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  33 
 
 
393 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
1168 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
366 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
447 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  32.62 
 
 
671 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  29.76 
 
 
451 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
605 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
386 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
485 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
748 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
446 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
472 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
446 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
599 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
468 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  32.04 
 
 
459 aa  87  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  33.8 
 
 
464 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  31.49 
 
 
795 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  29.21 
 
 
451 aa  86.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  30.34 
 
 
525 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  32.24 
 
 
485 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
665 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  31.75 
 
 
474 aa  85.9  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
700 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  29.33 
 
 
287 aa  85.5  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
795 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  28.95 
 
 
1809 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
795 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
795 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  32.72 
 
 
680 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  32.72 
 
 
680 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  32.72 
 
 
619 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.41 
 
 
482 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
486 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0564  putative signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
448 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
470 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal  0.956112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
470 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  30.52 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  29.65 
 
 
497 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
671 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  26.01 
 
 
392 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  30.5 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  29.68 
 
 
467 aa  82.4  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
450 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
469 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  31.84 
 
 
447 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
700 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
447 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>