More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3827 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
472 aa  946    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.59 
 
 
476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  38.41 
 
 
521 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
471 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  35.55 
 
 
478 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  36.18 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
468 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  32.75 
 
 
439 aa  179  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  35.73 
 
 
486 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  37.54 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  32.77 
 
 
488 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  28.41 
 
 
452 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  33.94 
 
 
490 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  34.72 
 
 
475 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3467  putative signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
446 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.548069  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3269  ATPase domain-containing protein  33.62 
 
 
446 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329893  normal  0.409282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  36.36 
 
 
489 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  29.69 
 
 
482 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
496 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
573 aa  124  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  31.91 
 
 
459 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3302  histidine kinase  34.76 
 
 
455 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1786  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.92 
 
 
479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663112  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
336 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  35.09 
 
 
680 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  36.11 
 
 
325 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  30.71 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3593  histidine kinase  31.71 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  34.74 
 
 
619 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
490 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
658 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  34.74 
 
 
680 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  33 
 
 
662 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
662 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
795 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  40.38 
 
 
485 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
795 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
421 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1029  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.71 
 
 
462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
439 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.43 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
771 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
603 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  34.43 
 
 
527 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
424 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  34.26 
 
 
687 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  29.84 
 
 
497 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  34.15 
 
 
368 aa  113  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
795 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4452  ATPase domain-containing protein  30.52 
 
 
509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  30 
 
 
640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  33.94 
 
 
392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
1168 aa  111  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
489 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
770 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
425 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  32.59 
 
 
477 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
692 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4916  histidine kinase  29.97 
 
 
509 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.69179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
490 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
493 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
334 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
801 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
506 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0306012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  32.85 
 
 
671 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  31.54 
 
 
683 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
359 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  34.33 
 
 
373 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
665 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
748 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  36.48 
 
 
383 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  35.1 
 
 
740 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  29.26 
 
 
388 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  30.41 
 
 
366 aa  107  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
671 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
485 aa  107  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  36.61 
 
 
795 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  26.95 
 
 
447 aa  107  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
700 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  34.16 
 
 
710 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  34.16 
 
 
710 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
700 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
748 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
801 aa  106  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  32.97 
 
 
515 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  35.27 
 
 
575 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
703 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0477  two-component sensor histidine kinase  34.33 
 
 
488 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
468 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>