More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3830 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 496 aa  985    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.19 
 
 		 560 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.56 
 
 		 448 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 493 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  29.59 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.59 
 
 		 486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 476 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  31.6 
 
 		 477 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 506 aa  169  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0306012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4452  ATPase domain-containing protein  32.81 
 
 		 509 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4916  histidine kinase  32.58 
 
 		 509 aa  167  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.69179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  29.81 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1905  putative signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0907492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  29.86 
 
 		 490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  32.55 
 
 		 478 aa  143  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 421 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 425 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 424 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 471 aa  136  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  28.04 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  35.2 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 475 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 472 aa  127  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  31.55 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  27.18 
 
 		 468 aa  118  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 468 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0029863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  32.4 
 
 		 453 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1786  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  28.83 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.48 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 366 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1029  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  29.52 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  30.89 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  28.97 
 
 		 514 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 513 aa  107  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 474 aa  105  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 494 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 658 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 671 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  28.83 
 
 		 687 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0477  two-component sensor histidine kinase  31.3 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  28.01 
 
 		 482 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 582 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  34.65 
 
 		 582 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  33.85 
 
 		 325 aa  100  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 489 aa  100  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  26.83 
 
 		 497 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3467  putative signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.548069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2604  signal transduction histidine kinase glucose-6-phosphate-like protein  27.76 
 
 		 495 aa  99.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 770 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 378 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 662 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  30 
 
 		 619 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 490 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  32.43 
 
 		 461 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  34.69 
 
 		 456 aa  97.8  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  30 
 
 		 680 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  32.79 
 
 		 368 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 1168 aa  97.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  31.97 
 
 		 662 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 333 aa  97.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 485 aa  97.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 665 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  30.51 
 
 		 640 aa  97.1  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  33.76 
 
 		 463 aa  97.1  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 573 aa  96.7  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  36.2 
 
 		 373 aa  96.7  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4070  sensory histidine kinase UhpB  31.8 
 
 		 500 aa  96.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  33.03 
 
 		 683 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 493 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 401 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 595 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 401 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3269  ATPase domain-containing protein  29.97 
 
 		 446 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329893  normal  0.409282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  28.25 
 
 		 488 aa  96.3  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  29.33 
 
 		 388 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  31.82 
 
 		 493 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  30.17 
 
 		 1226 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 526 aa  95.9  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 700 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 546 aa  95.9  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  27.63 
 
 		 783 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 700 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3302  histidine kinase  28.16 
 
 		 455 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  32.33 
 
 		 463 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  32.33 
 
 		 463 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  29.37 
 
 		 680 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 479 aa  95.1  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 480 aa  95.1  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>