More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0302 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 560 aa  1128    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.19 
 
 		 496 aa  388  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.56 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 473 aa  170  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  29.94 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 506 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0306012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 476 aa  163  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4452  ATPase domain-containing protein  29.1 
 
 		 509 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.87 
 
 		 466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4916  histidine kinase  28.77 
 
 		 509 aa  157  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.69179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.06 
 
 		 486 aa  156  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1905  putative signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 493 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0907492  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  29.7 
 
 		 439 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  33.59 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 424 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 425 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  30.89 
 
 		 490 aa  133  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 471 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 421 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 453 aa  124  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  28.61 
 
 		 475 aa  124  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  31.13 
 
 		 527 aa  123  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 424 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 468 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 439 aa  120  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.96 
 
 		 466 aa  120  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  33.62 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 475 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  28.03 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1029  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  29.08 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  29.01 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  34.78 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 476 aa  114  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  32.35 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2604  signal transduction histidine kinase glucose-6-phosphate-like protein  30.46 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 363 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 573 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 513 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  28.87 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 468 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0029863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  31.68 
 
 		 521 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 595 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3503  sensory histidine kinase UhpB  32.93 
 
 		 505 aa  106  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 598 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  31.17 
 
 		 680 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1786  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  28.87 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663112  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  31.17 
 
 		 619 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  30.83 
 
 		 687 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  30.65 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 596 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  30.77 
 
 		 680 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  29.66 
 
 		 598 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  33.48 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  31.55 
 
 		 453 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 594 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 658 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  33.47 
 
 		 683 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1774  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 519 aa  102  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  26.65 
 
 		 482 aa  101  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 384 aa  101  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 333 aa  101  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 336 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3467  putative signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.548069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 468 aa  100  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  28.57 
 
 		 783 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 770 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 662 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 514 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  33.85 
 
 		 325 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 334 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 489 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 494 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  31.52 
 
 		 662 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0179  histidine kinase  33.77 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 707 aa  97.8  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 474 aa  97.1  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 370 aa  97.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 684 aa  97.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  29.6 
 
 		 525 aa  97.1  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  32.03 
 
 		 447 aa  96.3  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3849  histidine kinase  30.26 
 
 		 497 aa  96.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 582 aa  96.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  28.18 
 
 		 388 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 447 aa  96.3  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  28.09 
 
 		 582 aa  96.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 466 aa  95.9  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 703 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 775 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  29.3 
 
 		 497 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 376 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.0505439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 700 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 700 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 700 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 700 aa  95.1  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 485 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>