More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4966 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4452  ATPase domain-containing protein  88.48 
 
 		 509 aa  825    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4916  histidine kinase  88.69 
 
 		 509 aa  826    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.69179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 506 aa  995    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0306012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.19 
 
 		 493 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  54.63 
 
 		 477 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.92 
 
 		 476 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1905  putative signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 493 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0907492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  34.28 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 560 aa  177  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.42 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  33.77 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  29.07 
 
 		 486 aa  150  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 453 aa  148  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0029863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  34.41 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  29.09 
 
 		 475 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  29.79 
 
 		 490 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 472 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1029  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.38 
 
 		 462 aa  110  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1786  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  28.79 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.2 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0477  two-component sensor histidine kinase  31.8 
 
 		 488 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3849  histidine kinase  35.49 
 
 		 497 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  28.87 
 
 		 468 aa  103  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2604  signal transduction histidine kinase glucose-6-phosphate-like protein  33.22 
 
 		 495 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  35.38 
 
 		 521 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  32.74 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  35 
 
 		 488 aa  98.2  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 424 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 439 aa  97.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  29.55 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  29.75 
 
 		 459 aa  94.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 424 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 513 aa  93.2  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 336 aa  91.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  28.7 
 
 		 497 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  28.34 
 
 		 527 aa  90.9  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  29.15 
 
 		 513 aa  90.9  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5914  histidine kinase  30.63 
 
 		 288 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0349357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  32.64 
 
 		 671 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 799 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  32.06 
 
 		 447 aa  89.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 513 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 447 aa  89.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  32.6 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000090  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  29.65 
 
 		 500 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 573 aa  89  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.92 
 
 		 373 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 421 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  35.12 
 
 		 459 aa  87  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  29.1 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4120  sensory histidine kinase UhpB  30.04 
 
 		 500 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  30.04 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  32.63 
 
 		 683 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4178  sensory histidine kinase UhpB  30.04 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 1101 aa  84.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  27.68 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3269  ATPase domain-containing protein  30.98 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329893  normal  0.409282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  32.35 
 
 		 670 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4070  sensory histidine kinase UhpB  29.63 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  22.83 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  29.52 
 
 		 509 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 700 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3999  sensory histidine kinase UhpB  29.63 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4015  sensory histidine kinase UhpB  29.63 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 1229 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  31.06 
 
 		 799 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  26.33 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  29.07 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  29.07 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  27.49 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  28.63 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  31.06 
 
 		 797 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  31.92 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 553 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3302  histidine kinase  28.17 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  31.36 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 446 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 671 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 490 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 339 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 700 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 535 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 541 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  31.27 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 695 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  32.08 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>