More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0321 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
476 aa  934    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.59 
 
 
472 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
471 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  36.89 
 
 
521 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  34.08 
 
 
478 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  31.95 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  34.71 
 
 
439 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  36.63 
 
 
453 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  33.33 
 
 
488 aa  143  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.77 
 
 
466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.18 
 
 
486 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3467  putative signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.548069  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  34.9 
 
 
490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
496 aa  127  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3269  ATPase domain-containing protein  32.88 
 
 
446 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329893  normal  0.409282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.43 
 
 
482 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  39.72 
 
 
710 aa  120  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  39.72 
 
 
710 aa  120  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  34.18 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
490 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3593  histidine kinase  32.88 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1029  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.96 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
560 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
424 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 
462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
770 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 
462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
662 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  33.2 
 
 
459 aa  111  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  33.44 
 
 
662 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
573 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
658 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  30.36 
 
 
475 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
336 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  40 
 
 
485 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
366 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
424 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  34.32 
 
 
783 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  37.09 
 
 
377 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
346 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  36.52 
 
 
830 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0477  two-component sensor histidine kinase  37.36 
 
 
488 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
359 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
493 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  29.75 
 
 
640 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
446 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
348 aa  106  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
493 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  35.75 
 
 
485 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
671 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
476 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
384 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
691 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  30.74 
 
 
497 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
363 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
490 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
484 aa  104  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  33.74 
 
 
527 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
471 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
688 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
665 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  34.82 
 
 
325 aa  103  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
485 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
779 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  32.9 
 
 
515 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  37.78 
 
 
463 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
370 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  35.86 
 
 
458 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  36.06 
 
 
456 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  27.62 
 
 
459 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
333 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  35.59 
 
 
343 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
439 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  31.7 
 
 
477 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
386 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3302  histidine kinase  33.33 
 
 
455 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
403 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
700 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
492 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  34.68 
 
 
492 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  34.68 
 
 
492 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  34.68 
 
 
492 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  34.68 
 
 
492 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
700 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.62 
 
 
383 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  34.68 
 
 
463 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  34.68 
 
 
463 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3763  Histidine kinase  35.5 
 
 
394 aa  99.8  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.597205  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
748 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3782  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
377 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  36.95 
 
 
466 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
486 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
401 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
459 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>