More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5892 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 446 aa  843    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3269  ATPase domain-containing protein  66.82 
 
 		 446 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329893  normal  0.409282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3467  putative signal transduction histidine kinase  66.37 
 
 		 446 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.548069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3593  histidine kinase  66.14 
 
 		 446 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  54.33 
 
 		 453 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  42.23 
 
 		 478 aa  249  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 468 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  34.84 
 
 		 521 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.96 
 
 		 466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.76 
 
 		 486 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  32.12 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 473 aa  119  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1029  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  35.31 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 476 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  32.18 
 
 		 477 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 573 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  33.87 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 496 aa  106  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.66 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 560 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  30.55 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1905  putative signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0907492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1786  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.22 
 
 		 479 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  34.29 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0477  two-component sensor histidine kinase  36.19 
 
 		 488 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 476 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  29.54 
 
 		 527 aa  96.7  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  31.69 
 
 		 490 aa  96.7  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  32.71 
 
 		 325 aa  93.6  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 298 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1667  ATPase domain-containing protein  36.13 
 
 		 384 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1984  histidine kinase  36.13 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  33.94 
 
 		 298 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.28 
 
 		 466 aa  91.3  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  32.87 
 
 		 313 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  32.24 
 
 		 783 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4452  ATPase domain-containing protein  32.58 
 
 		 509 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2580  histidine kinase  30.83 
 
 		 530 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  26.22 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  33.94 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  31.06 
 
 		 772 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4916  histidine kinase  31.82 
 
 		 509 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.69179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.43 
 
 		 323 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  39.61 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  25 
 
 		 388 aa  86.7  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  32.5 
 
 		 414 aa  86.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3503  sensory histidine kinase UhpB  31.28 
 
 		 505 aa  86.3  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  31.34 
 
 		 797 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 700 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2604  signal transduction histidine kinase glucose-6-phosphate-like protein  32.88 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0306012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  31.25 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  30.88 
 
 		 799 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  31.53 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  32.26 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.0505439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 771 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 692 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 775 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  34.63 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  30 
 
 		 509 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  29.57 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  28.64 
 
 		 638 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  29.57 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3849  histidine kinase  33.46 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  27.86 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  37.16 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 795 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  33.59 
 
 		 720 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1033  sensor protein comP  27.2 
 
 		 762 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000608596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  31.17 
 
 		 683 aa  80.1  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 1168 aa  80.1  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  29.02 
 
 		 645 aa  79.7  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  28.64 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  31.86 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  33.19 
 
 		 710 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 1101 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  33.19 
 
 		 710 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  31.88 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 770 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  29.88 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>