More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3503 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03552  sensory histidine kinase in two-component regulatory sytem with UhpA  78.92 
 
 		 500 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0035  histidine kinase  78.92 
 
 		 500 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4178  sensory histidine kinase UhpB  79.92 
 
 		 500 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4033  sensory histidine kinase UhpB  77.71 
 
 		 500 aa  666    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3503  sensory histidine kinase UhpB  100 
 
 		 505 aa  992    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4120  sensory histidine kinase UhpB  80.92 
 
 		 500 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4176  sensory histidine kinase UhpB  79.51 
 
 		 497 aa  683    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4015  sensory histidine kinase UhpB  80.72 
 
 		 500 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03494  hypothetical protein  78.92 
 
 		 500 aa  686    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0031  sensory histidine kinase UhpB  78.92 
 
 		 500 aa  686    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  81.12 
 
 		 499 aa  715    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5098  sensory histidine kinase UhpB  78.31 
 
 		 501 aa  678    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.118457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4251  sensory histidine kinase UhpB  79.51 
 
 		 497 aa  683    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4070  sensory histidine kinase UhpB  80.32 
 
 		 500 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3999  sensory histidine kinase UhpB  80.52 
 
 		 500 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3881  sensory histidine kinase UhpB  79.51 
 
 		 497 aa  683    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000090  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  42.86 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  47.13 
 
 		 513 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  45.8 
 
 		 509 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  46 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  45.8 
 
 		 509 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  34.59 
 
 		 527 aa  248  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 513 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 513 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  35.4 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  35.73 
 
 		 525 aa  236  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1774  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 519 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  35.86 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 560 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.71 
 
 		 466 aa  119  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  38.57 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 573 aa  117  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.51 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  34.23 
 
 		 490 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  30.4 
 
 		 619 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  36.67 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  30.4 
 
 		 680 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  30.4 
 
 		 680 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 552 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  30.03 
 
 		 515 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  31.42 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 595 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1692  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 443 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0719701 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 703 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 490 aa  107  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  35.05 
 
 		 452 aa  107  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 462 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 462 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 700 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 700 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 596 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 703 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 700 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 480 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  34.56 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  35.75 
 
 		 325 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  29.73 
 
 		 687 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 700 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 707 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 684 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  37.44 
 
 		 710 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  31.17 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  37.44 
 
 		 710 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 336 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  31.05 
 
 		 683 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 594 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 671 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  32.91 
 
 		 640 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  33.33 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  31.36 
 
 		 458 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  32.5 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  34.48 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  33.77 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  32.24 
 
 		 772 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 775 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 770 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 471 aa  101  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 775 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3677  histidine kinase  35.15 
 
 		 408 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  31.27 
 
 		 830 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 378 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  33.33 
 
 		 323 aa  100  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  31.08 
 
 		 598 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 598 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  37.74 
 
 		 485 aa  100  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3782  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 475 aa  99.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  32.41 
 
 		 447 aa  99.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  35.19 
 
 		 296 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 385 aa  99  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>