More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2580 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2580  histidine kinase  100 
 
 
530 aa  1053    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4708  histidine kinase  40.96 
 
 
523 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  34.29 
 
 
249 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  34.87 
 
 
254 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  34.26 
 
 
260 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  37.04 
 
 
244 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  35.59 
 
 
271 aa  135  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  35.71 
 
 
264 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  34.75 
 
 
271 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  33.47 
 
 
261 aa  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  34.16 
 
 
258 aa  130  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
269 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  33.61 
 
 
257 aa  127  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  33.47 
 
 
257 aa  126  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  34.32 
 
 
261 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  32.92 
 
 
259 aa  126  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  32.67 
 
 
259 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  33.9 
 
 
266 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  31.6 
 
 
247 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
247 aa  124  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  32.03 
 
 
246 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  31.36 
 
 
260 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  32.64 
 
 
503 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  32.37 
 
 
513 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 
275 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  31.45 
 
 
257 aa  120  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  32.26 
 
 
253 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  30.74 
 
 
278 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  30.67 
 
 
247 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  31.9 
 
 
246 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  30.58 
 
 
259 aa  118  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  34.73 
 
 
283 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2133  ABC transporter related protein  32.79 
 
 
511 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0375585  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  33.47 
 
 
261 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
684 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
700 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
707 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
700 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  33.47 
 
 
261 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
703 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  33.76 
 
 
258 aa  116  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  30.11 
 
 
512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  29.84 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  33.89 
 
 
261 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  31.25 
 
 
495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
700 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  31.38 
 
 
248 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  31.17 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  34.15 
 
 
252 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  28.1 
 
 
266 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  32.93 
 
 
264 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  29.63 
 
 
259 aa  115  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  33.19 
 
 
263 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  32.63 
 
 
261 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  32.75 
 
 
260 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1595  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  32.38 
 
 
511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.6 
 
 
266 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4320  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  33.91 
 
 
511 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  30.6 
 
 
266 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  35 
 
 
511 aa  114  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4290  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  33.91 
 
 
511 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293045  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4402  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  33.91 
 
 
511 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  30.6 
 
 
266 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4405  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  33.91 
 
 
511 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365646  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  30.6 
 
 
266 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  33.19 
 
 
392 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4472  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  33.91 
 
 
511 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  30.6 
 
 
266 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  30.6 
 
 
266 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  30.6 
 
 
266 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.42 
 
 
255 aa  114  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 
266 aa  114  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  30.8 
 
 
276 aa  114  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2145  ABC transporter related  32.38 
 
 
511 aa  114  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1659  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  31.97 
 
 
511 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.935771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3644  ABC transporter related  33.19 
 
 
508 aa  113  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
703 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  31.28 
 
 
276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1714  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  32.38 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2126  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  31.97 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  29.22 
 
 
262 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  30.6 
 
 
267 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  30.6 
 
 
278 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  30.6 
 
 
288 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  33.89 
 
 
512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  30.8 
 
 
313 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  31.05 
 
 
258 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  29.79 
 
 
265 aa  111  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  33.93 
 
 
249 aa  111  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
462 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  33.74 
 
 
619 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 
288 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0560  ABC transporter related protein  34.93 
 
 
256 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
462 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 
504 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  33.74 
 
 
680 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  33.74 
 
 
680 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  32.55 
 
 
391 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>