More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5342 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  65.57 
 
 		 244 aa  316  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  50.41 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  50.61 
 
 		 257 aa  239  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  48.58 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  49.59 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  50.21 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  48.79 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  47.79 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  50.41 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  48.77 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  49.38 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  48.78 
 
 		 254 aa  231  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  48.98 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  45.87 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  48.97 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  49.59 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  46.06 
 
 		 243 aa  228  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  47.54 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  47.77 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  48.36 
 
 		 278 aa  227  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  44.44 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  47.95 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  50.83 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  48.56 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  46.53 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  48.36 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  45.45 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.04 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  47.35 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.04 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.04 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.04 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.04 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.04 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  49.18 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  45.08 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 		 275 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  45.68 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  46.12 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  46.09 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  49.37 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 261 aa  218  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  49.59 
 
 		 257 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  44.9 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  46.03 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  48.54 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  45.9 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  49 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  46.91 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  46.75 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  43.72 
 
 		 264 aa  215  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  48.59 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  45.04 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 260 aa  214  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  46.91 
 
 		 265 aa  214  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  44.81 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.98 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  44.4 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  49.12 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  47.79 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  45.8 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  43.95 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  46.28 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  44.22 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 269 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 285 aa  211  7e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  45.49 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  47.39 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  45.71 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  43.57 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  45.63 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  44.49 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  45.97 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  43.55 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  43.37 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  49.17 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  43.39 
 
 		 264 aa  208  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  43.67 
 
 		 265 aa  208  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.55 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  47.9 
 
 		 249 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  45.08 
 
 		 261 aa  208  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  45.93 
 
 		 275 aa  207  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  44.13 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  43.27 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  44.53 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  42.15 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  46.31 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  45.71 
 
 		 273 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  44.18 
 
 		 252 aa  205  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  42.8 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 		 265 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  46.31 
 
 		 265 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  46.72 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>