More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1574 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  64.41 
 
 		 271 aa  307  9e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  62.06 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  62.9 
 
 		 254 aa  305  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  63.98 
 
 		 271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  62.76 
 
 		 261 aa  301  8.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  62.55 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  65.82 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  62.4 
 
 		 266 aa  297  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  63.71 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  62 
 
 		 257 aa  294  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  60.91 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  60.08 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  59.45 
 
 		 275 aa  285  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  60.92 
 
 		 313 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  58.9 
 
 		 269 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  58 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  53.57 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  52.4 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  50.97 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  54.17 
 
 		 269 aa  240  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  57.41 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  49.8 
 
 		 244 aa  237  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  52.44 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  54.69 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  52.7 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  50.41 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  50.2 
 
 		 258 aa  230  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  47.92 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 278 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  50 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  52.73 
 
 		 277 aa  225  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.64 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  53.67 
 
 		 276 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  46.37 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  46.97 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  52.29 
 
 		 273 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  52.29 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  49.59 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  48.76 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  47.95 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  46.64 
 
 		 271 aa  218  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.64 
 
 		 286 aa  217  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.75 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.13 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  52.75 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  47.18 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  50.46 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.95 
 
 		 258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  47.95 
 
 		 258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  47.19 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  48.15 
 
 		 253 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  47.95 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  54.47 
 
 		 272 aa  214  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  45.77 
 
 		 261 aa  214  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  47.13 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  47.64 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  54.02 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  47.64 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  47.54 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  46.72 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  47.11 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  49.35 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  45.35 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  46.72 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  45.71 
 
 		 247 aa  208  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  46.96 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  45.58 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  43.53 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  46.94 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  51.79 
 
 		 263 aa  204  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  46.64 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  49.61 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  50.46 
 
 		 276 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  46.81 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.58 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  47.13 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  46.61 
 
 		 260 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  44.75 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  48.02 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  44.18 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  46.12 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  45.86 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  44.35 
 
 		 243 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  42.98 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  45.7 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  42.62 
 
 		 497 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  42.51 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  41.74 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.15 
 
 		 499 aa  195  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  41.74 
 
 		 288 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.34 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.34 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.34 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>