More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2855 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 274 aa  541  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  85.21 
 
 		 285 aa  442  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  83.98 
 
 		 284 aa  428  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  80.24 
 
 		 265 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  79.61 
 
 		 265 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  80.24 
 
 		 265 aa  407  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  81.56 
 
 		 266 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  78.65 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  78.66 
 
 		 263 aa  400  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  78.52 
 
 		 263 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  77.99 
 
 		 265 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  77.04 
 
 		 274 aa  378  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  69.44 
 
 		 260 aa  354  6.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  68.95 
 
 		 265 aa  350  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  74.59 
 
 		 275 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  65.5 
 
 		 268 aa  345  7e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  72.54 
 
 		 275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  65.86 
 
 		 260 aa  338  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  64.31 
 
 		 273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  71.31 
 
 		 266 aa  335  5e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  66.14 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  66.26 
 
 		 265 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  64.68 
 
 		 258 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  64.68 
 
 		 258 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  63.39 
 
 		 257 aa  331  8e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  66.26 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  65.35 
 
 		 264 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  63.78 
 
 		 258 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  63.92 
 
 		 259 aa  328  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  65.23 
 
 		 260 aa  322  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  61.87 
 
 		 261 aa  319  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  63.01 
 
 		 257 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  62.2 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  57.32 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  55.69 
 
 		 253 aa  261  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  54.1 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  52.55 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  49.62 
 
 		 271 aa  251  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  46.67 
 
 		 263 aa  231  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  49.19 
 
 		 254 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  48.77 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  49.8 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  48.98 
 
 		 250 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  44.03 
 
 		 266 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  45.82 
 
 		 264 aa  215  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  45.74 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  47.97 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  45.88 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  47.37 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  45.9 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  49.6 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  46.59 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 260 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  47.37 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  45.31 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  48.94 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  47.37 
 
 		 261 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  42.64 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  45.16 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  48.16 
 
 		 269 aa  204  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  48.19 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  45.45 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  47.13 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  43.32 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  43.67 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 269 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  42 
 
 		 278 aa  201  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  48.9 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  46.37 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  40.39 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  42.35 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  47.13 
 
 		 261 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.75 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  47.22 
 
 		 243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  42.35 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  44.13 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  45.34 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44.66 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  42.29 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  42.34 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  42 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  44 
 
 		 260 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  46.25 
 
 		 276 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  48.77 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  45.34 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  44.77 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 265 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  46.15 
 
 		 265 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  41.63 
 
 		 257 aa  191  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>