More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5186 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  100 
 
 
272 aa  521  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  67.06 
 
 
261 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  65.04 
 
 
265 aa  315  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  66.94 
 
 
276 aa  308  5.9999999999999995e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  66.94 
 
 
262 aa  308  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  65.29 
 
 
265 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  65.29 
 
 
265 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  65.57 
 
 
273 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  62.41 
 
 
273 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  62.14 
 
 
263 aa  298  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  62.2 
 
 
278 aa  295  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  63.22 
 
 
277 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  63.11 
 
 
276 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.75 
 
 
288 aa  281  7.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  60.74 
 
 
271 aa  279  4e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62.35 
 
 
286 aa  275  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  58.78 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 
275 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  56.75 
 
 
260 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  59.22 
 
 
260 aa  263  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  57.26 
 
 
254 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  59.5 
 
 
260 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  60.33 
 
 
263 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  57.68 
 
 
252 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  57.68 
 
 
271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  58.68 
 
 
276 aa  258  9e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  57.14 
 
 
264 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  57.26 
 
 
271 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 
252 aa  255  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  54.92 
 
 
269 aa  255  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  55.19 
 
 
261 aa  254  9e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  53.26 
 
 
260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  57.85 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  56.85 
 
 
261 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  55.97 
 
 
258 aa  251  9.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0750  ABC transporter related protein  57.75 
 
 
260 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  56.85 
 
 
257 aa  248  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  55.14 
 
 
313 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  56.43 
 
 
261 aa  241  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  52.8 
 
 
269 aa  241  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  54.47 
 
 
261 aa  237  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  53.69 
 
 
253 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  51.42 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  53.69 
 
 
254 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  50.61 
 
 
244 aa  224  8e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  49.81 
 
 
275 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  52.07 
 
 
246 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  49.19 
 
 
271 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  47.72 
 
 
249 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  47.76 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  48.77 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  50.59 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
275 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  51.24 
 
 
261 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  50.41 
 
 
247 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  50 
 
 
274 aa  218  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  48.3 
 
 
265 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  49.2 
 
 
272 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  49.17 
 
 
246 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  48.16 
 
 
273 aa  215  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  50 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  47.76 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  44.87 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  48.99 
 
 
266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  50.6 
 
 
250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  50.21 
 
 
247 aa  211  7e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  46.99 
 
 
263 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  45.78 
 
 
260 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  47.76 
 
 
257 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  48.56 
 
 
283 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  46.83 
 
 
263 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  46.25 
 
 
258 aa  209  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  46.85 
 
 
260 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  48.57 
 
 
254 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  46.77 
 
 
284 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.87 
 
 
261 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  47.24 
 
 
259 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  51.87 
 
 
261 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  47.76 
 
 
259 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  45.02 
 
 
257 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  49.37 
 
 
254 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  44.44 
 
 
280 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  47.98 
 
 
245 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  47.18 
 
 
260 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  45.78 
 
 
265 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  46.18 
 
 
260 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  44.7 
 
 
264 aa  205  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  45.75 
 
 
266 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 
258 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0560  ABC transporter related protein  47.88 
 
 
256 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 
278 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.96 
 
 
265 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1857  sugar ABC transporter ATPase  47.13 
 
 
288 aa  204  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  47.35 
 
 
258 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  41.98 
 
 
288 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 
271 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  47.47 
 
 
265 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  46.15 
 
 
265 aa  201  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  46.53 
 
 
258 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>