More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5969 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  100 
 
 		 268 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  89.62 
 
 		 260 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  86.92 
 
 		 260 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  87.5 
 
 		 265 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  84.44 
 
 		 264 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  83.2 
 
 		 261 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  79.77 
 
 		 259 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  83.4 
 
 		 259 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  83.4 
 
 		 258 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  81.78 
 
 		 257 aa  425  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  83.4 
 
 		 258 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  83.81 
 
 		 258 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  79.84 
 
 		 260 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  76.65 
 
 		 273 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  74.8 
 
 		 265 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  69.02 
 
 		 265 aa  352  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  67.06 
 
 		 265 aa  345  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  65.5 
 
 		 274 aa  345  6e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  66.54 
 
 		 266 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  66.15 
 
 		 265 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  66.13 
 
 		 284 aa  331  7.000000000000001e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  63.18 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  64.78 
 
 		 260 aa  330  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  67.05 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  61.66 
 
 		 257 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  64.26 
 
 		 263 aa  319  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  66.15 
 
 		 263 aa  318  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  66.54 
 
 		 272 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  65.76 
 
 		 265 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  64.4 
 
 		 275 aa  308  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  63.16 
 
 		 266 aa  305  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  62.11 
 
 		 275 aa  301  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  58.98 
 
 		 257 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  54.03 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  52.03 
 
 		 260 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  49.19 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  49.61 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  48.39 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  46.77 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  47.77 
 
 		 263 aa  232  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  49.8 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  45.77 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  45.17 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  45.24 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  45.24 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  47.13 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  47.15 
 
 		 244 aa  215  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  45.56 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  45.02 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  45.56 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  42.23 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  44.76 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  47.01 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  44.18 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  45.24 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  44.13 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  43.7 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  44.08 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 283 aa  205  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  43.15 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  43.95 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  43.72 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  40.16 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  41.77 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  45.63 
 
 		 269 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  43.31 
 
 		 280 aa  201  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  43.27 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  42.74 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  42.8 
 
 		 247 aa  198  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  44.35 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.24 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  44.88 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.24 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.24 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.24 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.24 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.24 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  43.78 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.78 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  43.78 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  40.64 
 
 		 262 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  43.5 
 
 		 245 aa  195  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  41.94 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  40 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  40.56 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  43.6 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.49 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>