More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2852 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  100 
 
 		 265 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  83.14 
 
 		 261 aa  411  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  67.59 
 
 		 262 aa  334  7.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  68.8 
 
 		 276 aa  331  8e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  65.62 
 
 		 265 aa  321  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  65.62 
 
 		 265 aa  321  8e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  63.98 
 
 		 273 aa  318  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  64.77 
 
 		 276 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  66.4 
 
 		 288 aa  315  6e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  63.22 
 
 		 273 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  63.92 
 
 		 277 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  65.61 
 
 		 286 aa  306  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  62.2 
 
 		 278 aa  294  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  66.8 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  60 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  59.92 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  58.26 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  60.74 
 
 		 252 aa  275  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  61 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  58 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  57.79 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  58.16 
 
 		 260 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  58.51 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  59.58 
 
 		 263 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  58.68 
 
 		 275 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  54.44 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  57.68 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0750  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  58.16 
 
 		 252 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  58.09 
 
 		 271 aa  255  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  55.06 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  58.09 
 
 		 271 aa  254  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  56.85 
 
 		 266 aa  251  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  56.9 
 
 		 313 aa  251  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  58.58 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  55.97 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  57.14 
 
 		 264 aa  241  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  54.58 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  53.09 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  54.69 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  52.24 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  51.41 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  49.81 
 
 		 271 aa  231  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  51.25 
 
 		 257 aa  228  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  49.19 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  50.6 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  48.16 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  46.86 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  48.59 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  47.39 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  46.91 
 
 		 249 aa  214  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  49.21 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  45.8 
 
 		 261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  48.16 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1857  sugar ABC transporter ATPase  48.35 
 
 		 288 aa  208  6e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  47.08 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  47.35 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.48 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  46.53 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  48.78 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  46.91 
 
 		 245 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  48.19 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  45.8 
 
 		 248 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  45.42 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  45.15 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  43.58 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  43.75 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  48.55 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  47.28 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  48.16 
 
 		 275 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  46.03 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  48.21 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  47.97 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  45.73 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  46.64 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  46.27 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  46.22 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.27 
 
 		 265 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  47.72 
 
 		 261 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.72 
 
 		 261 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  45.38 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  46.59 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  43.57 
 
 		 502 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  46.77 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  45.5 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  43.72 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  44.08 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  43.62 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  46.59 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  46.59 
 
 		 274 aa  188  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  45.71 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>