More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1713 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  85.77 
 
 
301 aa  434  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  68.5 
 
 
280 aa  360  9e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  69.77 
 
 
316 aa  355  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  67.98 
 
 
305 aa  355  5e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  70.92 
 
 
255 aa  354  6.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  67.44 
 
 
258 aa  353  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  68.53 
 
 
315 aa  353  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  70.08 
 
 
262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  68.91 
 
 
294 aa  341  8e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  65.34 
 
 
262 aa  340  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  66.8 
 
 
259 aa  340  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  64.57 
 
 
264 aa  340  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  66.01 
 
 
259 aa  338  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  65.34 
 
 
266 aa  334  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  63.35 
 
 
269 aa  330  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  60.32 
 
 
265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  65.22 
 
 
282 aa  328  6e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  61.18 
 
 
278 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  61.18 
 
 
288 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  61.26 
 
 
266 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.66 
 
 
266 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  61.66 
 
 
266 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  62.8 
 
 
289 aa  323  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  61.66 
 
 
266 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  61.66 
 
 
266 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  61.66 
 
 
266 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  61.66 
 
 
266 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  61.66 
 
 
266 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  61.51 
 
 
282 aa  323  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  61.39 
 
 
271 aa  321  9.000000000000001e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  60.16 
 
 
267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  60.78 
 
 
274 aa  318  7e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  61.26 
 
 
267 aa  316  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  60.63 
 
 
274 aa  315  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  60.47 
 
 
274 aa  314  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  59.53 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  59.36 
 
 
267 aa  294  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  58.47 
 
 
266 aa  292  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  59.51 
 
 
262 aa  291  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  58.17 
 
 
264 aa  291  7e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  58.3 
 
 
266 aa  290  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  50.21 
 
 
247 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  45.49 
 
 
257 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  45.04 
 
 
249 aa  215  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 
527 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  44.96 
 
 
524 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  44.54 
 
 
524 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  44.96 
 
 
524 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  44.54 
 
 
524 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  44.54 
 
 
524 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  44.54 
 
 
524 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  44.31 
 
 
265 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 
265 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  45.49 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  46.44 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  43.62 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  44.76 
 
 
266 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  44.44 
 
 
273 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  44 
 
 
285 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  44.12 
 
 
518 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  44.08 
 
 
278 aa  198  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  44.92 
 
 
265 aa  198  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  42.91 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  45 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  42.98 
 
 
254 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  41.27 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  44 
 
 
274 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  43.57 
 
 
258 aa  195  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  44.58 
 
 
261 aa  195  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  43.51 
 
 
257 aa  194  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  43.9 
 
 
265 aa  194  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  45.19 
 
 
273 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  40.96 
 
 
260 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  41.74 
 
 
243 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.9 
 
 
265 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  44.35 
 
 
261 aa  193  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  43.25 
 
 
264 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  41.84 
 
 
521 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  41.15 
 
 
263 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  43.15 
 
 
269 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  41.73 
 
 
255 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  40.25 
 
 
245 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  41.43 
 
 
271 aa  191  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  41.63 
 
 
256 aa  191  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  42.15 
 
 
258 aa  191  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  42.75 
 
 
266 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  44.4 
 
 
250 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  41.91 
 
 
271 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  42.58 
 
 
265 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  45.71 
 
 
259 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 
288 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  42.92 
 
 
264 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  41.27 
 
 
257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  45.92 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  44.17 
 
 
262 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.47 
 
 
518 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  42.34 
 
 
253 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  43.08 
 
 
284 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  43.57 
 
 
276 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>