More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2316 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  69.41 
 
 
282 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  67.17 
 
 
267 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  63.46 
 
 
315 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  63.53 
 
 
271 aa  330  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  62.31 
 
 
274 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  63.92 
 
 
289 aa  325  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  59.85 
 
 
301 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  62.06 
 
 
274 aa  317  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  60.78 
 
 
269 aa  316  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  62.2 
 
 
305 aa  315  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  61.26 
 
 
274 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  61.11 
 
 
258 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  59.53 
 
 
260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  55.43 
 
 
262 aa  293  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  60.08 
 
 
294 aa  286  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  56.6 
 
 
316 aa  282  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  58.5 
 
 
255 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  51.35 
 
 
262 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  52.71 
 
 
266 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  52.76 
 
 
280 aa  264  8.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.16 
 
 
259 aa  262  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  52.16 
 
 
259 aa  261  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  50.97 
 
 
265 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  52.53 
 
 
264 aa  260  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  50.58 
 
 
282 aa  259  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.15 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  50.78 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.54 
 
 
266 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.54 
 
 
266 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.54 
 
 
266 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.54 
 
 
266 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.54 
 
 
266 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.54 
 
 
266 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.54 
 
 
266 aa  251  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  51.33 
 
 
267 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  50.19 
 
 
288 aa  244  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.19 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  50.2 
 
 
266 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  49.03 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  46.9 
 
 
266 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  47.24 
 
 
264 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  47.75 
 
 
247 aa  188  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  46.59 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  45.02 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  42.86 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  42.42 
 
 
256 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  40.5 
 
 
245 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  44.77 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  44.69 
 
 
255 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  44.92 
 
 
269 aa  175  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.54 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  40.43 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  42.98 
 
 
257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  42.11 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  39.67 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  41.56 
 
 
257 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  42.67 
 
 
277 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  44.34 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
288 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  42.73 
 
 
276 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  42.86 
 
 
273 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  41.87 
 
 
260 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  41.7 
 
 
273 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  39.65 
 
 
247 aa  169  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  44.34 
 
 
259 aa  169  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  43.05 
 
 
260 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  42.73 
 
 
259 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  40.74 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  45.29 
 
 
264 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.34 
 
 
286 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  38.63 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  40.57 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  42.22 
 
 
266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  39.47 
 
 
263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  43.23 
 
 
244 aa  165  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
278 aa  164  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  43.44 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  42.11 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  43.81 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  40.86 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  41.15 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  41.59 
 
 
294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  42.6 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  44.39 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  42.36 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  42.6 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  38.4 
 
 
261 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  42.99 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  43.05 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  42.73 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  41.44 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  43.17 
 
 
250 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  38.21 
 
 
253 aa  161  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  39.18 
 
 
259 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.38 
 
 
265 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>