More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2600 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  517  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  73.39 
 
 		 256 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  71.37 
 
 		 264 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0846  ABC transporter related  70.33 
 
 		 261 aa  342  4e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409124  normal  0.0400632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  61.45 
 
 		 266 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  42.98 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  44.09 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  43.04 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  44.17 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  41.98 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  45.19 
 
 		 294 aa  191  7e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  44.35 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  45.22 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  43.78 
 
 		 245 aa  188  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  41.11 
 
 		 274 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0915  ABC transporter related  43.28 
 
 		 251 aa  188  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  45.69 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  45.83 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  41.67 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  45.23 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  44.96 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  42.74 
 
 		 273 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  44.39 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  40.51 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.26 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.05 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  43.81 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  40.93 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  41.28 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44.76 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  43.38 
 
 		 260 aa  181  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 		 248 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  43.97 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  44.55 
 
 		 262 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  42.08 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  41.42 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  42.31 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  42.44 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  44.72 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  41.48 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  40.59 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  40.59 
 
 		 267 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  42.92 
 
 		 278 aa  178  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  44.04 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 247 aa  178  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  42.31 
 
 		 247 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.92 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  42.19 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  41.82 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  39.5 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  42.6 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  43.59 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  41.6 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  38.96 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  41.95 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  44.3 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  41.53 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  43.26 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.57 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  41.63 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  45.05 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  42.6 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  39.74 
 
 		 305 aa  175  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  39.74 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  40.99 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  44.14 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  42.6 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2159  ABC transporter related  40.85 
 
 		 500 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.634503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  44.95 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  40.17 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  40.53 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  43.24 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  40.85 
 
 		 265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  39.66 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  43.69 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  41.56 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  43.89 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  41.15 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>