More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0832 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  83.95 
 
 
315 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  71.84 
 
 
258 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  65.15 
 
 
282 aa  358  6e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  67.98 
 
 
260 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  68.13 
 
 
255 aa  352  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  67.19 
 
 
301 aa  352  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  64.59 
 
 
271 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  62.41 
 
 
274 aa  345  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  68.99 
 
 
294 aa  345  5e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  64.66 
 
 
289 aa  339  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  64.84 
 
 
267 aa  335  7.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  65.88 
 
 
269 aa  334  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  63.67 
 
 
316 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  65.35 
 
 
274 aa  325  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  65.61 
 
 
274 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  57.87 
 
 
264 aa  316  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  60.7 
 
 
262 aa  315  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  62.2 
 
 
267 aa  315  6e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  55.43 
 
 
262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 
259 aa  301  7.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  55.94 
 
 
266 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  59.92 
 
 
280 aa  300  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  58.85 
 
 
259 aa  299  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.71 
 
 
266 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  58.89 
 
 
267 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  55.51 
 
 
265 aa  295  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.92 
 
 
278 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  56.92 
 
 
288 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.51 
 
 
266 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 
266 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 
266 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 
266 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 
266 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 
266 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 
266 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  54.05 
 
 
282 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  53.6 
 
 
266 aa  278  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 
267 aa  275  8e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  53.06 
 
 
266 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  49.22 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  49 
 
 
264 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  47.46 
 
 
247 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  43.03 
 
 
260 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  43.58 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  42.86 
 
 
277 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  41.73 
 
 
265 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  42.45 
 
 
265 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  42.45 
 
 
260 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.21 
 
 
265 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  43.21 
 
 
265 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  43.93 
 
 
268 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  42.06 
 
 
257 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  44.96 
 
 
265 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  44.31 
 
 
257 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  42.56 
 
 
273 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  42.52 
 
 
265 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  44.54 
 
 
266 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 
265 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  41.8 
 
 
261 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  40.94 
 
 
266 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  40.24 
 
 
265 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  42.68 
 
 
260 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  41.8 
 
 
273 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
285 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  42.15 
 
 
276 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  41.76 
 
 
284 aa  186  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  40.5 
 
 
258 aa  185  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  44.26 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  41.49 
 
 
258 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  38.96 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  41.03 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  41.27 
 
 
273 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 
275 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  40.48 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  41.41 
 
 
256 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  42.68 
 
 
261 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  38.43 
 
 
245 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  40.7 
 
 
278 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  41 
 
 
274 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  41.91 
 
 
244 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  40.86 
 
 
259 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  37.92 
 
 
245 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  41.56 
 
 
259 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  42.19 
 
 
260 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 
258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  43.67 
 
 
263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  41.77 
 
 
258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  40.16 
 
 
254 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  44.35 
 
 
272 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  41.84 
 
 
259 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  41.7 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  42.86 
 
 
274 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  39.2 
 
 
266 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  41.43 
 
 
262 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  43.3 
 
 
255 aa  178  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  39.59 
 
 
248 aa  178  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  38.89 
 
 
253 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 
263 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>