More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4037 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  100 
 
 		 301 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  85.77 
 
 		 260 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  68.63 
 
 		 315 aa  362  6e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  67.19 
 
 		 305 aa  353  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  66.8 
 
 		 280 aa  352  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  68.53 
 
 		 258 aa  350  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  72.33 
 
 		 316 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  67.57 
 
 		 262 aa  347  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  69.72 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  62.65 
 
 		 266 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  63.04 
 
 		 264 aa  333  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  61.42 
 
 		 282 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  61.48 
 
 		 262 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  59.52 
 
 		 265 aa  328  8e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  65.08 
 
 		 259 aa  328  9e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  63.1 
 
 		 289 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  64.68 
 
 		 259 aa  326  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  59.93 
 
 		 282 aa  324  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  65.7 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  59.25 
 
 		 267 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  58.94 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  61.42 
 
 		 269 aa  318  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  58.56 
 
 		 271 aa  315  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.68 
 
 		 266 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.08 
 
 		 266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 		 266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  59.29 
 
 		 274 aa  311  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  61.11 
 
 		 274 aa  310  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  59.29 
 
 		 267 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  58.1 
 
 		 278 aa  308  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  58.1 
 
 		 288 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  59.92 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  58.4 
 
 		 267 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  57.65 
 
 		 266 aa  290  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  59.06 
 
 		 262 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  57.66 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  57.14 
 
 		 266 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  49.58 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  44.31 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  43.89 
 
 		 285 aa  205  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  42.86 
 
 		 249 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  42.23 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  44.71 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  42.75 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  41.74 
 
 		 245 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  44.94 
 
 		 265 aa  199  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  44.71 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  44.08 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  42.06 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  40.66 
 
 		 524 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  44.88 
 
 		 273 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.53 
 
 		 265 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.11 
 
 		 527 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  43.48 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  44.26 
 
 		 244 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.28 
 
 		 524 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  42.04 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  42.39 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.34 
 
 		 524 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.34 
 
 		 524 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  41.87 
 
 		 524 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  43.03 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.98 
 
 		 524 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  41.83 
 
 		 518 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0353  ABC transporter related  41.2 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  41.2 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  42.4 
 
 		 265 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  42.51 
 
 		 521 aa  188  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 271 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  43.09 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  41.56 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  40.65 
 
 		 271 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  44.39 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  43.21 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  41.46 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  43.17 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  39.6 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  42.23 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  40.85 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  42.37 
 
 		 261 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  41.46 
 
 		 261 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  41.11 
 
 		 265 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  41.83 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  40.49 
 
 		 260 aa  185  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  41.67 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  40.65 
 
 		 271 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  42.8 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  41.56 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  44.49 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  40 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>