More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0654 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  100 
 
 		 267 aa  537  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  67.17 
 
 		 267 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  65.38 
 
 		 282 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  65.25 
 
 		 274 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  64.62 
 
 		 271 aa  349  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  65.23 
 
 		 274 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  65.48 
 
 		 274 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  64.84 
 
 		 305 aa  335  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  64.68 
 
 		 289 aa  334  7.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  65.08 
 
 		 269 aa  332  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  62.16 
 
 		 315 aa  332  4e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  61.26 
 
 		 260 aa  316  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  61.11 
 
 		 301 aa  316  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  61.96 
 
 		 258 aa  311  9e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  61.66 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  60.63 
 
 		 316 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  54.69 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  57.85 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.72 
 
 		 259 aa  275  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  54.33 
 
 		 280 aa  273  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  53.54 
 
 		 259 aa  268  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  51.76 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  51.59 
 
 		 262 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  49.62 
 
 		 266 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  53.73 
 
 		 282 aa  261  8.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  50.79 
 
 		 265 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  52.34 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.78 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.78 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.78 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.78 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.78 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.78 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.78 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  51.38 
 
 		 288 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.38 
 
 		 278 aa  248  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.57 
 
 		 266 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  47.45 
 
 		 266 aa  241  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  46.51 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  47.22 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  45.88 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  46.48 
 
 		 264 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  45.68 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  43.48 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.45 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  44.79 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  43.9 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44.27 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  43.97 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  49.32 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  46.35 
 
 		 277 aa  188  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  43.1 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  45.78 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  46.41 
 
 		 269 aa  185  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  43.2 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  41.95 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  43.44 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  43.62 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  47.95 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  44.17 
 
 		 247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  42.62 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  41.09 
 
 		 285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  40.76 
 
 		 243 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  43.93 
 
 		 261 aa  182  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  43.4 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  41.92 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0915  ABC transporter related  41.46 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  42.4 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  41.43 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  46.43 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  44.74 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  40.54 
 
 		 261 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  40.98 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  38.98 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.43 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  42.39 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  44.63 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  45.15 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  44.03 
 
 		 261 aa  175  7e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.4 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  39.36 
 
 		 265 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  46.58 
 
 		 264 aa  174  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  41.91 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  38.34 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  40.47 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  44.13 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.76 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  41.53 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  40.96 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  39.76 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  40.32 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  46.58 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  42.39 
 
 		 313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  42.47 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>