More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0842 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 278 aa  235  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  48.78 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  47.58 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  50.2 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  46.72 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  48.78 
 
 		 261 aa  225  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  44.49 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  46.94 
 
 		 254 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  46.12 
 
 		 261 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  46.75 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  44.11 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  46.67 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  45.6 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  47.11 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  45.75 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  43.9 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  46.72 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  48.37 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  44.76 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  44.44 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  44.49 
 
 		 271 aa  215  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  43.43 
 
 		 260 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  46.12 
 
 		 261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  43.03 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  46.59 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.9 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  44.08 
 
 		 271 aa  211  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  45.78 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  44.27 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  46.37 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  45.71 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  45.08 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  45.71 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  42.97 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  43.44 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  45.68 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  45.31 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  44.31 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  44.8 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 250 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  43.03 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.26 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  41.46 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  42.98 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  41.8 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.2 
 
 		 286 aa  194  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  45.16 
 
 		 260 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  41.43 
 
 		 260 aa  191  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  39.34 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  41.2 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  38.89 
 
 		 274 aa  191  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  40.98 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.37 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  41.3 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  38.34 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  38.18 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  38.98 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  40.82 
 
 		 265 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  40.49 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  38.34 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  39.31 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  38.13 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  39.76 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  40.16 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  41.18 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  39.29 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  37.8 
 
 		 282 aa  182  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0750  ABC transporter related protein  40.86 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  43.03 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  39.76 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  39.11 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  41.11 
 
 		 280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.07 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  37.85 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  38.62 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  37.85 
 
 		 264 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>