More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2415 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  100 
 
 
273 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  78.82 
 
 
265 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  78.6 
 
 
260 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  76.65 
 
 
268 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  78 
 
 
260 aa  411  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  78.66 
 
 
259 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  77.29 
 
 
260 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  77.08 
 
 
264 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  74.51 
 
 
257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  76.98 
 
 
258 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  74.33 
 
 
261 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  76.98 
 
 
258 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  76.19 
 
 
258 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  73.39 
 
 
265 aa  391  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  71.76 
 
 
259 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  65.41 
 
 
265 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  65.04 
 
 
265 aa  338  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  64.31 
 
 
274 aa  337  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  67.48 
 
 
266 aa  335  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  66.4 
 
 
265 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  64.82 
 
 
285 aa  331  9e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  64.37 
 
 
257 aa  326  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  64.43 
 
 
260 aa  326  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  60.22 
 
 
284 aa  325  4.0000000000000003e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  62.69 
 
 
274 aa  317  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  64.68 
 
 
272 aa  316  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  64.43 
 
 
263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  66.13 
 
 
266 aa  311  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  63.75 
 
 
263 aa  310  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  67.77 
 
 
275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  63.49 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  62.8 
 
 
257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  63.6 
 
 
265 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  53.57 
 
 
258 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  53.78 
 
 
253 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  51.19 
 
 
260 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  51.57 
 
 
254 aa  255  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  49.6 
 
 
260 aa  241  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  50.4 
 
 
271 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  46.69 
 
 
263 aa  235  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  49.8 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
254 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  47.39 
 
 
261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  44.84 
 
 
258 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  49.19 
 
 
261 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  47.18 
 
 
271 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  47.76 
 
 
244 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  49.59 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  47.18 
 
 
271 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  46.59 
 
 
257 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  46.43 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  45.1 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  46.37 
 
 
254 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  46.03 
 
 
313 aa  215  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  47.37 
 
 
264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  47.5 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  46.56 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  47.77 
 
 
250 aa  211  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  47.98 
 
 
257 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  44.09 
 
 
266 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 
266 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.71 
 
 
266 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 
266 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 
266 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 
266 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 
266 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 
266 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 
266 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  41.9 
 
 
265 aa  208  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  45.68 
 
 
267 aa  208  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  43.87 
 
 
280 aa  208  8e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  45.67 
 
 
262 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  44.53 
 
 
262 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  45.9 
 
 
266 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  44.27 
 
 
282 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 
278 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  44.09 
 
 
257 aa  206  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  44.86 
 
 
288 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  47.35 
 
 
269 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  45.24 
 
 
258 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  43.27 
 
 
249 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  45.97 
 
 
260 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  42.96 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  43.53 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  44.49 
 
 
265 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44.19 
 
 
273 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  44.44 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  42.46 
 
 
257 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  41.57 
 
 
264 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  40.94 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  43.55 
 
 
261 aa  198  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  43.03 
 
 
261 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  42.52 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  42.97 
 
 
247 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  46.19 
 
 
254 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  45.34 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  43.09 
 
 
245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  41.57 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>