More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1901 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  87.13 
 
 		 272 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  80.75 
 
 		 265 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  84.73 
 
 		 263 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  79.09 
 
 		 284 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  77.99 
 
 		 274 aa  419  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  80.86 
 
 		 263 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  75 
 
 		 285 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  75 
 
 		 265 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  80.86 
 
 		 274 aa  397  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  74.33 
 
 		 266 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  74.22 
 
 		 265 aa  394  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  67.57 
 
 		 265 aa  353  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  68.85 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  65.76 
 
 		 268 aa  341  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  69.35 
 
 		 275 aa  340  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  64.98 
 
 		 257 aa  336  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  65.45 
 
 		 260 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  63.6 
 
 		 273 aa  332  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  63.92 
 
 		 265 aa  331  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  64.82 
 
 		 261 aa  329  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  63.57 
 
 		 260 aa  328  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  65.75 
 
 		 259 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  62.93 
 
 		 264 aa  324  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  68.15 
 
 		 275 aa  322  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  66.27 
 
 		 260 aa  321  9.000000000000001e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  63.35 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  62.95 
 
 		 259 aa  319  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  63.35 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  66.94 
 
 		 266 aa  318  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  62.15 
 
 		 258 aa  316  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  64.26 
 
 		 257 aa  314  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  55.34 
 
 		 258 aa  275  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  57.09 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  54.1 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  51.44 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  49.8 
 
 		 271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  51.23 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  47.06 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  45.56 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  45.25 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  46.31 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  43.6 
 
 		 282 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  44.36 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  44.22 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  41.11 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  43.7 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  43.63 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  45.16 
 
 		 244 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  47.2 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  44.66 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  46.59 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 		 278 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  41.04 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  40.84 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  40.93 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  44.44 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  41.27 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  41.67 
 
 		 262 aa  201  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  43.65 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  46.53 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  43.48 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  44.05 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  43.15 
 
 		 247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  42.41 
 
 		 259 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  45.23 
 
 		 269 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  45.49 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  42.23 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  42.57 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  43.25 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  44 
 
 		 255 aa  195  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4627  ABC transporter related  44.59 
 
 		 505 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556183 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  42.51 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  43.98 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  44.05 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  42 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  42.46 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42.64 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.44 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  42.58 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  42.29 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  43.2 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  40.07 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>