More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4627 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4627  ABC transporter related  100 
 
 		 505 aa  1003    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0689  ABC transporter related  58 
 
 		 507 aa  554  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.135079 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  42.23 
 
 		 501 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  43 
 
 		 504 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  40.83 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  42.23 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.98 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  42.18 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  42.18 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  41.98 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  41.98 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.97 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  42.17 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  40.04 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  41.98 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  42.17 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  42.17 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3707  ABC transporter related  43.11 
 
 		 508 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  41.83 
 
 		 516 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  41.98 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  42.17 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  43.08 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  41.78 
 
 		 501 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  42.35 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  40.32 
 
 		 525 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  43.2 
 
 		 497 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  39.29 
 
 		 503 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  40.04 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  42.18 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3109  ABC transporter related  39.45 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00977673  hitchhiker  0.0000567489 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  42.89 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  41.6 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.67 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  43.9 
 
 		 519 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  41.46 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  43.16 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  40.28 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 497 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  42.86 
 
 		 520 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  40.99 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3409  ABC transporter related  42.51 
 
 		 508 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  41.67 
 
 		 499 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 494 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  39.8 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  41.67 
 
 		 499 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.8 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  42.48 
 
 		 495 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  39.92 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  43.19 
 
 		 517 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6737  xylose transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.020966  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  41.84 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  41.18 
 
 		 513 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.92 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  40.04 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  44.82 
 
 		 509 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  40.83 
 
 		 504 aa  365  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  40.08 
 
 		 500 aa  365  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0361  ABC transporter related  43 
 
 		 515 aa  364  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 		 501 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  43.7 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  41.67 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  42.29 
 
 		 507 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39.54 
 
 		 496 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0318  ABC transporter related protein  37.92 
 
 		 498 aa  363  3e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  40.77 
 
 		 530 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 		 494 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.63 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40.67 
 
 		 492 aa  363  4e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 511 aa  362  6e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2340  xylose transporter ATP-binding subunit  41.93 
 
 		 519 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  42.24 
 
 		 501 aa  362  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  39.02 
 
 		 499 aa  362  8e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.53 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  42.16 
 
 		 519 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.53 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.53 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  40.72 
 
 		 505 aa  362  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.53 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  41.27 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2890  ABC transporter related protein  42.63 
 
 		 516 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0580102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 511 aa  361  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40.95 
 
 		 506 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  43 
 
 		 505 aa  361  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 494 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>