More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2340 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6035  xylose transporter ATP-binding subunit  91.88 
 
 
519 aa  947    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0730737  normal  0.8225 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  67.86 
 
 
511 aa  693    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  68.51 
 
 
514 aa  697    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1151  xylose transporter ATP-binding subunit  68.06 
 
 
511 aa  697    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  67.66 
 
 
528 aa  713    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  65.94 
 
 
515 aa  687    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0775  xylose transporter ATP-binding subunit  62.77 
 
 
512 aa  642    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2885  xylose transporter ATP-binding subunit  67.92 
 
 
518 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700201  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  68.65 
 
 
518 aa  716    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  79.72 
 
 
517 aa  816    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2340  xylose transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
519 aa  1037    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2620  xylose transporter ATP-binding subunit  80.89 
 
 
519 aa  856    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  78.91 
 
 
525 aa  829    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  79.72 
 
 
517 aa  816    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  89.4 
 
 
519 aa  929    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  89.4 
 
 
519 aa  928    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6335  xylose transporter ATP-binding subunit  91.3 
 
 
519 aa  946    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6737  xylose transporter ATP-binding subunit  89.4 
 
 
519 aa  929    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.020966  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4210  xylose transporter ATP-binding subunit  91.52 
 
 
519 aa  954    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  65.94 
 
 
515 aa  687    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6631  xylose transporter ATP-binding subunit  80.69 
 
 
519 aa  853    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  54.94 
 
 
513 aa  548  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  54.74 
 
 
513 aa  548  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 
513 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  55.53 
 
 
509 aa  548  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 
513 aa  548  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 
513 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 
513 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  51.29 
 
 
507 aa  548  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  55.14 
 
 
513 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  54.74 
 
 
513 aa  547  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  54.65 
 
 
513 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  53.16 
 
 
513 aa  535  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  53.08 
 
 
510 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  53.08 
 
 
510 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0062  xylose transporter ATP-binding subunit  53.89 
 
 
513 aa  534  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  52.77 
 
 
513 aa  528  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0100  xylose transporter ATP-binding subunit  53.68 
 
 
513 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0585  xylose transporter ATP-binding subunit  51.99 
 
 
504 aa  522  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
511 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  49.7 
 
 
504 aa  491  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  46.35 
 
 
505 aa  487  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  47.7 
 
 
509 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  46.26 
 
 
525 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  47.41 
 
 
508 aa  442  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  46.38 
 
 
512 aa  435  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  46.56 
 
 
508 aa  435  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.12 
 
 
517 aa  433  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27960  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 
512 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887259  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  46.86 
 
 
512 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  44.84 
 
 
495 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  45.69 
 
 
511 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  44.73 
 
 
501 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29470  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.94 
 
 
513 aa  425  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.85 
 
 
497 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  46.26 
 
 
515 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  48.82 
 
 
507 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  47.13 
 
 
524 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  44.73 
 
 
501 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3402  ABC transporter related protein  48.32 
 
 
522 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2945  ABC transporter related  45.31 
 
 
541 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  47.46 
 
 
511 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 
501 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0757  ABC transporter related protein  49.11 
 
 
525 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0933075  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0384  ABC transporter related  46.72 
 
 
509 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.51 
 
 
529 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  43.86 
 
 
512 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  41.95 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2997  ABC transporter related  45.99 
 
 
519 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.746869  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2514  ABC transporter related protein  46.29 
 
 
518 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  45.03 
 
 
507 aa  418  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  42.86 
 
 
511 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  44.42 
 
 
530 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0878  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.51 
 
 
529 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  44.73 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3199  ABC transporter-related protein  46.25 
 
 
507 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.28101 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  44.31 
 
 
495 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  43.96 
 
 
500 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  43.71 
 
 
504 aa  411  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  46.06 
 
 
521 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0405  ABC transporter related protein  44.93 
 
 
514 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  43.74 
 
 
501 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1181  ABC transporter related  45.07 
 
 
520 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000288216 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  43.5 
 
 
501 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  43.74 
 
 
501 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.5 
 
 
501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  43.5 
 
 
501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  43.5 
 
 
501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2686  ABC transporter related  42.91 
 
 
516 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4718  ABC transporter related  47.55 
 
 
564 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  43.5 
 
 
501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  43.11 
 
 
513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  43.08 
 
 
512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  43.5 
 
 
501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.16 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  47.01 
 
 
514 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  43.7 
 
 
501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3073  ABC transporter related  43.05 
 
 
511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.697432  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  43.5 
 
 
501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>