More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2683 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1247  ABC sugar transporter, ATPase subunit  92.59 
 
 		 499 aa  889    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2907  ABC transporter related  92.18 
 
 		 499 aa  887    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  100 
 
 		 499 aa  986    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  64.71 
 
 		 494 aa  605  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3409  ABC transporter related  55.71 
 
 		 508 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4263  ABC transporter related  56.02 
 
 		 508 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3707  ABC transporter related  55.31 
 
 		 508 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  55.51 
 
 		 507 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  55.87 
 
 		 521 aa  511  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  55.47 
 
 		 511 aa  504  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4866  ABC transporter related  51.52 
 
 		 513 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2244  ABC transporter related  52.74 
 
 		 495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3675  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.13 
 
 		 495 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.973573  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0962  ABC transporter related  51.93 
 
 		 495 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3274  ABC transporter related  52.56 
 
 		 496 aa  468  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5263  ABC transporter related  52.6 
 
 		 530 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  44.02 
 
 		 499 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  43.46 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  44.38 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  46.36 
 
 		 508 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  47.07 
 
 		 514 aa  415  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  45.14 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  48.47 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  46.83 
 
 		 516 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  45.31 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  44.06 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  42.39 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  45.65 
 
 		 512 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  44.06 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.51 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.87 
 
 		 513 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.51 
 
 		 517 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.9 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.07 
 
 		 520 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  46.67 
 
 		 518 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  43 
 
 		 503 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.4 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  44.16 
 
 		 508 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  43.35 
 
 		 510 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  45.12 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  44.38 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  46.29 
 
 		 519 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 		 515 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.77 
 
 		 513 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.12 
 
 		 501 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.77 
 
 		 513 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.35 
 
 		 492 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  45.51 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.26 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  43.26 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  44.72 
 
 		 503 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  43.26 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.64 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.23 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  43.8 
 
 		 507 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  43.89 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  45.19 
 
 		 498 aa  393  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.53 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  43.06 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.44 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  43.8 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  42.32 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  43.26 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  44.2 
 
 		 492 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.53 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  45.88 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  42.63 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  44.53 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  43.86 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  43.79 
 
 		 492 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  43.06 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  43.35 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  43.06 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  41.7 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  41.24 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.78 
 
 		 524 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.2 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  40.08 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  42.63 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.68 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  43.06 
 
 		 516 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  43.55 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  45.25 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  45.45 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  38.73 
 
 		 493 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  43.06 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  42.77 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  44.49 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  43.86 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  45.36 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  43.06 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  43.06 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  43.06 
 
 		 516 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.51 
 
 		 517 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  42.34 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>