More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3540 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  100 
 
 
504 aa  1005    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  61.66 
 
 
501 aa  630  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3109  ABC transporter related  50.1 
 
 
500 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00977673  hitchhiker  0.0000567489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  48.48 
 
 
518 aa  501  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  49.4 
 
 
514 aa  497  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  49.49 
 
 
503 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  49.8 
 
 
494 aa  494  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  48.39 
 
 
503 aa  486  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  49.6 
 
 
499 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  48.48 
 
 
501 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  49.6 
 
 
499 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.82 
 
 
514 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  46.23 
 
 
516 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  51.12 
 
 
494 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.03 
 
 
514 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.03 
 
 
514 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  48.28 
 
 
512 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.03 
 
 
514 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.62 
 
 
520 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.85 
 
 
499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  46.77 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  48.27 
 
 
494 aa  468  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  44.72 
 
 
512 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  44.92 
 
 
513 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  50.3 
 
 
500 aa  466  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  46.65 
 
 
494 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.65 
 
 
494 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
504 aa  464  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.72 
 
 
512 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  45.84 
 
 
513 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.6 
 
 
513 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.65 
 
 
494 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  44.81 
 
 
516 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  43.29 
 
 
507 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3418  ABC transporter related  46.68 
 
 
526 aa  465  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247847  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  48.78 
 
 
495 aa  464  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.23 
 
 
515 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  48.3 
 
 
509 aa  463  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  50.71 
 
 
500 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.67 
 
 
497 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  45.4 
 
 
524 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.46 
 
 
525 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 
494 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 
494 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  44.51 
 
 
513 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  48.1 
 
 
520 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  43.72 
 
 
495 aa  458  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  44.44 
 
 
508 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 
494 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.85 
 
 
517 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  47.46 
 
 
503 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  45.45 
 
 
503 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  45.75 
 
 
523 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  46.72 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  45.45 
 
 
503 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  46.08 
 
 
496 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 
494 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  46.25 
 
 
513 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  46.54 
 
 
499 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.65 
 
 
504 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.74 
 
 
512 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.74 
 
 
512 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  46.08 
 
 
496 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  46.98 
 
 
496 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  44.99 
 
 
524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.84 
 
 
494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  46.65 
 
 
525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 
527 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  45.78 
 
 
524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  44.72 
 
 
514 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  47.27 
 
 
495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  44.79 
 
 
524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 
507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  45.99 
 
 
524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  46.56 
 
 
507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  44.79 
 
 
524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  46.45 
 
 
496 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  46.56 
 
 
507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  45.44 
 
 
513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  46.36 
 
 
500 aa  450  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  44.22 
 
 
518 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  44.74 
 
 
517 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  44.81 
 
 
493 aa  451  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.78 
 
 
524 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 
501 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  48.07 
 
 
501 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  44.2 
 
 
521 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  46.93 
 
 
508 aa  451  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  45.73 
 
 
506 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  45.63 
 
 
505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
506 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  45.75 
 
 
497 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  47.81 
 
 
502 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  45.73 
 
 
506 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  47.46 
 
 
498 aa  442  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
506 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
506 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  45.01 
 
 
506 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.51 
 
 
504 aa  442  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
506 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>