More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4174 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  72.41 
 
 
504 aa  726    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  100 
 
 
501 aa  1011    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  84.43 
 
 
501 aa  863    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  84.43 
 
 
501 aa  863    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  88.82 
 
 
501 aa  917    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  89.42 
 
 
501 aa  927    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  84.43 
 
 
501 aa  863    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  83.83 
 
 
516 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  83.83 
 
 
516 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  72.06 
 
 
501 aa  724    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  87.03 
 
 
501 aa  881    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  66.33 
 
 
501 aa  653    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  83.83 
 
 
516 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  72.06 
 
 
501 aa  727    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  83.83 
 
 
516 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  84.43 
 
 
501 aa  863    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  84.43 
 
 
501 aa  863    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  71.2 
 
 
501 aa  708    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  84.23 
 
 
501 aa  860    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  90.22 
 
 
501 aa  920    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  84.23 
 
 
501 aa  861    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  84.23 
 
 
501 aa  860    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  83.83 
 
 
501 aa  850    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  73.08 
 
 
500 aa  724    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  83.83 
 
 
501 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  53.04 
 
 
496 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 
501 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  51.93 
 
 
501 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  51.11 
 
 
497 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  50.81 
 
 
495 aa  503  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 
525 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  49.9 
 
 
525 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  49.2 
 
 
504 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  49.49 
 
 
494 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  49.4 
 
 
503 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  48.83 
 
 
512 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.47 
 
 
494 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  48.47 
 
 
494 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.47 
 
 
494 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.27 
 
 
494 aa  471  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  48.4 
 
 
513 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 
523 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
494 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  49 
 
 
503 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  49 
 
 
525 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  48.8 
 
 
508 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 
494 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  48.2 
 
 
514 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.3 
 
 
512 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  47.99 
 
 
513 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  46.91 
 
 
507 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  48.1 
 
 
512 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  48.78 
 
 
514 aa  465  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  48.1 
 
 
512 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  47.32 
 
 
507 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  47.07 
 
 
496 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  47.07 
 
 
496 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  46.69 
 
 
503 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 
494 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  46.98 
 
 
497 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.45 
 
 
494 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  47.37 
 
 
495 aa  463  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  47.79 
 
 
511 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  46.46 
 
 
503 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  46.84 
 
 
511 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  47.07 
 
 
501 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 
461 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  47.59 
 
 
502 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  47.03 
 
 
513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  48.88 
 
 
494 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  46.36 
 
 
503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  47.76 
 
 
499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  47.5 
 
 
505 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  47.27 
 
 
498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  48.28 
 
 
516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  46.01 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  46.14 
 
 
499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 
513 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  45.31 
 
 
513 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  46.71 
 
 
504 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  45.31 
 
 
513 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  45.31 
 
 
513 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  47.79 
 
 
514 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  45.31 
 
 
513 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  45.84 
 
 
497 aa  448  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  45.12 
 
 
513 aa  448  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  47.79 
 
 
514 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  46.01 
 
 
513 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  45.9 
 
 
513 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.78 
 
 
514 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  45.31 
 
 
513 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  46.22 
 
 
518 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 
517 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  46.22 
 
 
524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  46.01 
 
 
524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 
506 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.23 
 
 
513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  45.6 
 
 
524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 
517 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 
517 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>