More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1653 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  68.92 
 
 		 517 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  67.65 
 
 		 517 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  100 
 
 		 519 aa  1036    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  70.47 
 
 		 517 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  68.53 
 
 		 517 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  68.5 
 
 		 517 aa  666    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  68.92 
 
 		 517 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  67.85 
 
 		 517 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  68.92 
 
 		 517 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  70.47 
 
 		 517 aa  686    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  70.47 
 
 		 517 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  69.12 
 
 		 517 aa  666    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  63.12 
 
 		 518 aa  624  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  60.4 
 
 		 510 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  61.95 
 
 		 507 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0843  ABC transporter related  64.98 
 
 		 496 aa  593  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.0750454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  57.74 
 
 		 517 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  55.73 
 
 		 506 aa  547  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  55.91 
 
 		 507 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  55.19 
 
 		 506 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 507 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  55.71 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  54.18 
 
 		 506 aa  524  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  50.5 
 
 		 495 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  47.14 
 
 		 524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  47.96 
 
 		 524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  47.14 
 
 		 524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  46.54 
 
 		 515 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.58 
 
 		 527 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  47.59 
 
 		 516 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  49.11 
 
 		 525 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  46.63 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  47.14 
 
 		 524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  47.18 
 
 		 524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  47.34 
 
 		 524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  47.73 
 
 		 518 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  47.69 
 
 		 497 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.49 
 
 		 525 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  49.9 
 
 		 497 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  49.5 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  45.45 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  45.86 
 
 		 494 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  48.03 
 
 		 513 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  45.44 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  45.78 
 
 		 501 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 504 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  45.45 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  49 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.88 
 
 		 501 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  45.88 
 
 		 501 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  45.88 
 
 		 501 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  45.88 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  50 
 
 		 508 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  46.49 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  45.67 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  45.29 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  45.02 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  45.02 
 
 		 506 aa  435  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  48.49 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  45.44 
 
 		 516 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  45.88 
 
 		 501 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  45.45 
 
 		 516 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  45.88 
 
 		 501 aa  433  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  46.2 
 
 		 521 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  45.88 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.2 
 
 		 512 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  43.6 
 
 		 497 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  45.98 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  45.67 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  45.86 
 
 		 503 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  47.73 
 
 		 514 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  44.98 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  47.44 
 
 		 519 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  48.39 
 
 		 512 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  44 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  44.84 
 
 		 513 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  48.39 
 
 		 512 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  45.33 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  44.64 
 
 		 501 aa  428  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  45.04 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  47.47 
 
 		 523 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  46.18 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  44.6 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  44.55 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  45.11 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  42.47 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  45.13 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.78 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  42.91 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  45.8 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  45.79 
 
 		 528 aa  421  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  45.13 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  43.57 
 
 		 501 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3109  ABC transporter related  43.89 
 
 		 500 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00977673  hitchhiker  0.0000567489 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  45 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  48.8 
 
 		 508 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  45.15 
 
 		 500 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 510 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.86 
 
 		 492 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>