More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1242 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  100 
 
 		 518 aa  1047    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62 
 
 		 525 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  62.26 
 
 		 525 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  85.11 
 
 		 524 aa  893    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  83.11 
 
 		 527 aa  874    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  79.6 
 
 		 521 aa  790    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  76.64 
 
 		 515 aa  808    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  71.72 
 
 		 511 aa  721    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  86.48 
 
 		 524 aa  884    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  72.16 
 
 		 513 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  83.4 
 
 		 524 aa  879    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  86.48 
 
 		 524 aa  884    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  67.75 
 
 		 503 aa  687    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  83.02 
 
 		 524 aa  874    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  76.25 
 
 		 516 aa  797    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  65.18 
 
 		 523 aa  651    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  87.25 
 
 		 524 aa  880    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  73.14 
 
 		 513 aa  759    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  69.34 
 
 		 512 aa  732    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  71.76 
 
 		 513 aa  756    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  56.62 
 
 		 494 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  54.38 
 
 		 500 aa  549  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  49 
 
 		 506 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49 
 
 		 506 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49 
 
 		 506 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  49 
 
 		 506 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  49 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49 
 
 		 506 aa  505  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.2 
 
 		 506 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.2 
 
 		 506 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.4 
 
 		 506 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  49.4 
 
 		 506 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.57 
 
 		 512 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  51.27 
 
 		 514 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  51.49 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  52.36 
 
 		 512 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  51.49 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  51.64 
 
 		 513 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0944  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.51 
 
 		 506 aa  491  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  51.82 
 
 		 504 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.82 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  52.71 
 
 		 513 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.81 
 
 		 506 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 		 515 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  50.82 
 
 		 499 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.36 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.9 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.89 
 
 		 502 aa  481  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  47.61 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  47.48 
 
 		 494 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  50.91 
 
 		 507 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  49.49 
 
 		 494 aa  477  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 501 aa  472  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0318  ABC transporter related protein  47.68 
 
 		 498 aa  474  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  46.91 
 
 		 504 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  48.48 
 
 		 524 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2242  ABC transporter related  46.67 
 
 		 499 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  49.49 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  47.69 
 
 		 501 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  46.57 
 
 		 516 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  48.69 
 
 		 508 aa  465  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  45.23 
 
 		 503 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  46.46 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.84 
 
 		 501 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  46.84 
 
 		 501 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  47.86 
 
 		 503 aa  465  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  46.99 
 
 		 500 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  49.49 
 
 		 503 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.23 
 
 		 501 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  46.23 
 
 		 501 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  46.23 
 
 		 501 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.63 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  45.69 
 
 		 516 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  47.75 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  49.6 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  45.69 
 
 		 516 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  47.63 
 
 		 514 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.54 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  48.47 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0800  ABC transporter related  45.55 
 
 		 509 aa  460  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  47.63 
 
 		 514 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  46.23 
 
 		 501 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  46.23 
 
 		 501 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  45.75 
 
 		 516 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  45.69 
 
 		 516 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  44.03 
 
 		 496 aa  458  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  45.51 
 
 		 511 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  45.45 
 
 		 500 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 497 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  47.65 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  46.03 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  45.82 
 
 		 501 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>