More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3003 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  100 
 
 		 495 aa  960    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  51.52 
 
 		 514 aa  491  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  52.45 
 
 		 520 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  52.55 
 
 		 516 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  51.51 
 
 		 508 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.9 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  49.69 
 
 		 513 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  51.8 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  52.31 
 
 		 499 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  52.21 
 
 		 513 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  51.8 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  51.8 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  52.24 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  52.03 
 
 		 517 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  52.1 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  51.81 
 
 		 513 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  49.7 
 
 		 500 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  47.67 
 
 		 494 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  49.49 
 
 		 504 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  50.91 
 
 		 514 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  51.12 
 
 		 514 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  50.91 
 
 		 514 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  50.41 
 
 		 494 aa  473  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  47.98 
 
 		 499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  47.98 
 
 		 499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  49.7 
 
 		 502 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  46.96 
 
 		 497 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  47.57 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  50.3 
 
 		 503 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  47.98 
 
 		 524 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  49.39 
 
 		 495 aa  465  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  50.5 
 
 		 519 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  49.49 
 
 		 503 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  47.98 
 
 		 495 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  47.08 
 
 		 517 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 504 aa  458  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  50.3 
 
 		 517 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  49.9 
 
 		 504 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  48.48 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  46.15 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  49.2 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  51.43 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  49.5 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  49.5 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  49.4 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  49.5 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  46.46 
 
 		 506 aa  458  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  44.72 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  44.74 
 
 		 506 aa  455  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 		 517 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.91 
 
 		 517 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  50.52 
 
 		 508 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49 
 
 		 517 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49 
 
 		 517 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  48.99 
 
 		 511 aa  453  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  46.15 
 
 		 503 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  45.55 
 
 		 506 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  45.75 
 
 		 507 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  46.84 
 
 		 497 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 		 517 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 		 507 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  46.23 
 
 		 499 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 		 501 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  46.48 
 
 		 501 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  45.75 
 
 		 507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  47.24 
 
 		 525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  44.47 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  45.44 
 
 		 506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 		 525 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  45.33 
 
 		 524 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 		 527 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  44.92 
 
 		 524 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  45.55 
 
 		 501 aa  445  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  46.25 
 
 		 503 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  44.92 
 
 		 524 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  47.05 
 
 		 503 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  45.51 
 
 		 516 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  49.49 
 
 		 505 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  43.85 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  47.05 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  45.33 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  44.72 
 
 		 524 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  45.91 
 
 		 520 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  47.66 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  44.92 
 
 		 524 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  45.62 
 
 		 513 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  44.18 
 
 		 510 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  46.91 
 
 		 509 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  45.91 
 
 		 509 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  45.62 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  46.84 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  44.31 
 
 		 524 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  45.12 
 
 		 525 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.14 
 
 		 511 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  45.01 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 523 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  47.25 
 
 		 501 aa  438  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  45.66 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>