More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4658 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  100 
 
 		 497 aa  999    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  48.18 
 
 		 492 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  47.37 
 
 		 506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  47.47 
 
 		 507 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  47.58 
 
 		 506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  48.69 
 
 		 513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 506 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  47.47 
 
 		 507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  47.95 
 
 		 501 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.14 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 507 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  44.94 
 
 		 501 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 		 492 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  49.9 
 
 		 519 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 505 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  47.19 
 
 		 517 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  47.19 
 
 		 495 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 		 510 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49.9 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.9 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.9 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  47.45 
 
 		 497 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.7 
 
 		 517 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  45.4 
 
 		 506 aa  428  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  49.8 
 
 		 517 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  49.11 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  49.6 
 
 		 517 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  49.8 
 
 		 517 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  44.11 
 
 		 503 aa  423  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  47.43 
 
 		 508 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  43.64 
 
 		 525 aa  422  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  42.65 
 
 		 496 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  46.6 
 
 		 506 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  45.97 
 
 		 513 aa  425  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  49.8 
 
 		 517 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  48.91 
 
 		 517 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  44.06 
 
 		 506 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 		 494 aa  418  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  44.02 
 
 		 510 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  44.56 
 
 		 512 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  46.57 
 
 		 500 aa  418  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  44.4 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  46.57 
 
 		 498 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  43.86 
 
 		 496 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.12 
 
 		 506 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  42.8 
 
 		 499 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  43.99 
 
 		 496 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.5 
 
 		 492 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 499 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  47.58 
 
 		 518 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  44.94 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  45.07 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.59 
 
 		 499 aa  415  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  44.53 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  44.29 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.04 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  45.21 
 
 		 503 aa  415  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  43.84 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 		 507 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 		 507 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  46.44 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  46.95 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  45.62 
 
 		 505 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  44.04 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.52 
 
 		 507 aa  411  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  45.58 
 
 		 508 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  43.49 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1180  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.67 
 
 		 503 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0843  ABC transporter related  49 
 
 		 496 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.0750454 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.07 
 
 		 512 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 		 511 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.99 
 
 		 515 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  45.91 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  45.36 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3447  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  42.74 
 
 		 516 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.07 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  45.31 
 
 		 506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3483  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.36 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.07 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 522 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.58 
 
 		 515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.58 
 
 		 515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  44.58 
 
 		 508 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  42.74 
 
 		 516 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  42.68 
 
 		 501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  44.6 
 
 		 507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  45.66 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.36 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>