More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8259 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 509 aa  996    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  77 
 
 		 502 aa  715    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  68.47 
 
 		 521 aa  647    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  65.53 
 
 		 505 aa  629  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  65.19 
 
 		 522 aa  622  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 500 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10500  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  62.98 
 
 		 499 aa  595  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1351  ABC transporter related  58.97 
 
 		 508 aa  555  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.387252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  52.11 
 
 		 499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  45.42 
 
 		 494 aa  438  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  45.23 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  48.68 
 
 		 508 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 497 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2757  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.31 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  43.65 
 
 		 497 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  48.52 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  49.16 
 
 		 516 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.19 
 
 		 511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  42.71 
 
 		 525 aa  408  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.28 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  48.42 
 
 		 514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  48.42 
 
 		 514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  43.29 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  47.15 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  47.25 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  48.73 
 
 		 514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  44.09 
 
 		 510 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  47.35 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  44.22 
 
 		 524 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.96 
 
 		 516 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  44.42 
 
 		 524 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.7 
 
 		 515 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  45.45 
 
 		 516 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  45.51 
 
 		 517 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  44.42 
 
 		 524 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  44.86 
 
 		 514 aa  405  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  44.98 
 
 		 518 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.27 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  43.09 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.91 
 
 		 512 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  44.22 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.91 
 
 		 512 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  42.89 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  44.62 
 
 		 524 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  43.72 
 
 		 495 aa  395  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.81 
 
 		 527 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  45.62 
 
 		 516 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  44.02 
 
 		 524 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  48.23 
 
 		 519 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  43.03 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  44.42 
 
 		 516 aa  398  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  47.13 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  42.2 
 
 		 513 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 498 aa  395  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  45.38 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  43.79 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 525 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.4 
 
 		 522 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  40.64 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  43.83 
 
 		 537 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43.81 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.79 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  44.54 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0138907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 515 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 		 507 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  44.83 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  44.35 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 505 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  47.28 
 
 		 503 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  45.62 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  42.94 
 
 		 509 aa  395  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.61 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  43.23 
 
 		 497 aa  392  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  41.85 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  42.89 
 
 		 525 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 		 507 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2763  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.61 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691602  normal  0.315971 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  42.54 
 
 		 503 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.68 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  42.57 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 		 506 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 		 511 aa  392  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  39.6 
 
 		 508 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  41.34 
 
 		 495 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  45.73 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  43.54 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  41.85 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.25 
 
 		 506 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1064  ABC transporter related  45.47 
 
 		 504 aa  391  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0465117  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.69 
 
 		 517 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  44.33 
 
 		 513 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.47 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  43.54 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0590  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164103  normal  0.0495673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>