More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1064 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1064  ABC transporter related  100 
 
 		 504 aa  1009    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0465117  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4757  ABC transporter related  50.2 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139896  normal  0.719575 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4656  ABC transporter related  49.8 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489627  normal  0.659628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  48.79 
 
 		 525 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3768  ABC transporter related  49.6 
 
 		 514 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2649  ABC transporter related protein  49.4 
 
 		 518 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.684281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3251  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.7 
 
 		 507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3385  ABC transporter related  47.7 
 
 		 507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0913  ribose ABC transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 		 507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3524  ABC transporter related  44.06 
 
 		 514 aa  448  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1873  ABC transporter related  46.23 
 
 		 506 aa  448  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3638  ABC transporter related  44.62 
 
 		 532 aa  448  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0361  ABC transporter related  49 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5321  ABC transporter related  45.15 
 
 		 514 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0567275  normal  0.751648 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0860  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 514 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2913  ABC transporter related  45.89 
 
 		 514 aa  405  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762867  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1961  ABC transporter related  45.29 
 
 		 512 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1851  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 512 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 		 501 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0807  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.41753  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  41.97 
 
 		 501 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  43.14 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.19 
 
 		 499 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  41.97 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  41.12 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  41.28 
 
 		 495 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.72 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.62 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  45.47 
 
 		 509 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.25 
 
 		 524 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  43.29 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  42.2 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2803  ABC transporter related  42.51 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  42.14 
 
 		 501 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  39.26 
 
 		 496 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  40.76 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  40.36 
 
 		 504 aa  368  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 		 507 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  42.69 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  41.68 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 497 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  43.51 
 
 		 505 aa  364  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.32 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  41.88 
 
 		 501 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  42.97 
 
 		 507 aa  363  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 		 511 aa  363  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  42.37 
 
 		 515 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  39.84 
 
 		 499 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.56 
 
 		 495 aa  361  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.89 
 
 		 504 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  42.45 
 
 		 508 aa  361  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  41.65 
 
 		 504 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  42.38 
 
 		 520 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  41.97 
 
 		 516 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  40.67 
 
 		 504 aa  360  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  42.4 
 
 		 517 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  39.96 
 
 		 501 aa  360  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  42.28 
 
 		 516 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  41.77 
 
 		 516 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  38.59 
 
 		 494 aa  359  7e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  42.89 
 
 		 514 aa  359  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  42.89 
 
 		 514 aa  359  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.97 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  41.97 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  41.97 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.2 
 
 		 523 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 523 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  41.97 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.2 
 
 		 523 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  41.97 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  41.97 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  38.48 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  42.38 
 
 		 512 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  41.77 
 
 		 516 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  43.38 
 
 		 502 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  42.91 
 
 		 513 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43.69 
 
 		 513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  42.89 
 
 		 514 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  41.77 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 525 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  40.73 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  41.48 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  41.97 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  41.77 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  41.77 
 
 		 516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  42.32 
 
 		 507 aa  357  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  42.16 
 
 		 508 aa  357  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  41.77 
 
 		 501 aa  356  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.03 
 
 		 512 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.03 
 
 		 512 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  38.72 
 
 		 505 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.55 
 
 		 504 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38 
 
 		 515 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.55 
 
 		 504 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38 
 
 		 515 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 504 aa  355  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  40.56 
 
 		 525 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  41.87 
 
 		 502 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.6 
 
 		 496 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 		 504 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>