More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4656 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3768  ABC transporter related  80.28 
 
 		 514 aa  816    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4656  ABC transporter related  100 
 
 		 516 aa  1033    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489627  normal  0.659628 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4757  ABC transporter related  93.8 
 
 		 516 aa  978    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139896  normal  0.719575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  84.72 
 
 		 525 aa  874    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1873  ABC transporter related  52.89 
 
 		 506 aa  527  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3251  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  52.8 
 
 		 507 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3385  ABC transporter related  52.8 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0913  ribose ABC transporter ATP-binding protein  52.4 
 
 		 507 aa  512  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2649  ABC transporter related protein  52.06 
 
 		 518 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.684281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1064  ABC transporter related  49.9 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0465117  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5321  ABC transporter related  48.7 
 
 		 514 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0567275  normal  0.751648 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0860  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3524  ABC transporter related  48.4 
 
 		 514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0361  ABC transporter related  49.3 
 
 		 515 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2913  ABC transporter related  47.94 
 
 		 514 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3638  ABC transporter related  47.24 
 
 		 532 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0807  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.41753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1851  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.04 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1961  ABC transporter related  47.04 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  44.22 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  41.27 
 
 		 504 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  41.21 
 
 		 511 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  41.38 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.54 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  40.16 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 528 aa  389  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 504 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  44.2 
 
 		 502 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  42.89 
 
 		 514 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.85 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  44.13 
 
 		 503 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  41.45 
 
 		 525 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  40.68 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  40.85 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  40.68 
 
 		 516 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  40.85 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  40.85 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  40.68 
 
 		 516 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  40.68 
 
 		 516 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  40.85 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  40.68 
 
 		 516 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 		 501 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  41.78 
 
 		 512 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  40.99 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  40.9 
 
 		 518 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3044  ABC transporter related  40.59 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  41.05 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 525 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  40.53 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  41.43 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  39.76 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2972  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1873  sugar transport ATP-binding protein  40.59 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0103225 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  38.81 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  38.42 
 
 		 513 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 528 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  38.61 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  38.61 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  38.61 
 
 		 513 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  37.87 
 
 		 507 aa  378  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3337  ABC transporter related  42.24 
 
 		 521 aa  379  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.84 
 
 		 501 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  41.37 
 
 		 513 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.22 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  41.25 
 
 		 516 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  38.61 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  39.88 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  41.58 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  41.57 
 
 		 513 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  40.92 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  40.37 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  40.69 
 
 		 501 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  41.15 
 
 		 537 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  39.44 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  40.97 
 
 		 495 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  42.77 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.63 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  40.92 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  38.19 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  40.49 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  40.04 
 
 		 496 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  38.42 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  40.12 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  40.96 
 
 		 518 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  40.97 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.76 
 
 		 527 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  41.75 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3450  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  39.77 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  42.71 
 
 		 500 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  40.64 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  40.64 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1338  ABC transporter related  40 
 
 		 515 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224173  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  39.77 
 
 		 509 aa  371  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>