More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2649 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0913  ribose ABC transporter ATP-binding protein  77.93 
 
 		 507 aa  796    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2649  ABC transporter related protein  100 
 
 		 518 aa  1051    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.684281  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3385  ABC transporter related  78.13 
 
 		 507 aa  796    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3251  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  78.13 
 
 		 507 aa  796    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1873  ABC transporter related  70.95 
 
 		 506 aa  731    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4656  ABC transporter related  52.06 
 
 		 516 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489627  normal  0.659628 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4757  ABC transporter related  52.98 
 
 		 516 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139896  normal  0.719575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  52.17 
 
 		 525 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3768  ABC transporter related  52.44 
 
 		 514 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3524  ABC transporter related  49.22 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3638  ABC transporter related  48.81 
 
 		 532 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1064  ABC transporter related  49.49 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0465117  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1851  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.33 
 
 		 512 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1961  ABC transporter related  47.33 
 
 		 512 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0361  ABC transporter related  47.93 
 
 		 515 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5321  ABC transporter related  46.84 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0567275  normal  0.751648 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2913  ABC transporter related  44.1 
 
 		 514 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762867  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0860  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 514 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0807  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.41753  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  41.55 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.24 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.24 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.6 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  43.2 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  41.43 
 
 		 513 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  43.05 
 
 		 518 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.63 
 
 		 527 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  41.24 
 
 		 513 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  41.24 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.42 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.99 
 
 		 507 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  41.24 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  41.24 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  41.04 
 
 		 513 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  41.04 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  41.68 
 
 		 512 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 497 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.69 
 
 		 524 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  41.21 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.56 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.28 
 
 		 524 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  41.25 
 
 		 511 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  41.08 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  40.88 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0689  ABC transporter related  43.09 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.135079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  43.23 
 
 		 505 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  40.08 
 
 		 507 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 514 aa  365  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  38.52 
 
 		 511 aa  364  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 		 504 aa  364  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.24 
 
 		 494 aa  364  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 		 504 aa  364  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.3 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  40.35 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  41.3 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000458478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.28 
 
 		 516 aa  362  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  39 
 
 		 501 aa  361  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 515 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 515 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.35 
 
 		 501 aa  360  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  41.08 
 
 		 495 aa  360  4e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 507 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 525 aa  359  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  40.28 
 
 		 513 aa  359  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  38.99 
 
 		 504 aa  358  9e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.23 
 
 		 511 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  40.48 
 
 		 512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 507 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  40.24 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  40.24 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  39.38 
 
 		 516 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.24 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  39.38 
 
 		 516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6631  xylose transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 519 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  39.38 
 
 		 516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  40.24 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  40.24 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3337  ABC transporter related  40.59 
 
 		 521 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  39.38 
 
 		 516 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 		 507 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 		 523 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 		 523 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  41.43 
 
 		 499 aa  356  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  40.2 
 
 		 501 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  39.76 
 
 		 500 aa  356  6.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 523 aa  355  8.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.23 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.76 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.76 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>