More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1049 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  100 
 
 		 496 aa  1001    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  67.4 
 
 		 500 aa  666    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  49.09 
 
 		 518 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  48.37 
 
 		 524 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  48.37 
 
 		 524 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  49.19 
 
 		 512 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 		 527 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  47.77 
 
 		 513 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  48.17 
 
 		 524 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  48.17 
 
 		 524 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  49.08 
 
 		 523 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  47.97 
 
 		 513 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.19 
 
 		 512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  48.47 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  48.79 
 
 		 514 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  48.08 
 
 		 524 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  48.88 
 
 		 494 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  49.19 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  48.79 
 
 		 514 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  48.08 
 
 		 524 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  47.58 
 
 		 512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  47.57 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  49.49 
 
 		 514 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  48.47 
 
 		 512 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  48.98 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  48.58 
 
 		 514 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  48.47 
 
 		 512 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  48.88 
 
 		 514 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  47.67 
 
 		 497 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  49.79 
 
 		 494 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  48.68 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  47.99 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.55 
 
 		 525 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  47.76 
 
 		 525 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  48.27 
 
 		 496 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  49.08 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  47.76 
 
 		 516 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  46.54 
 
 		 511 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  47.17 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  49.9 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  47.55 
 
 		 521 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  49.19 
 
 		 508 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  47.66 
 
 		 494 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  48.88 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  48.68 
 
 		 503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  47.88 
 
 		 513 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  46.45 
 
 		 504 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  47.56 
 
 		 503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  50.3 
 
 		 495 aa  451  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 		 494 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.31 
 
 		 494 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.11 
 
 		 494 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.31 
 
 		 494 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.11 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  47.19 
 
 		 524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.11 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  45.86 
 
 		 508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  48.37 
 
 		 508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  46.76 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  46.11 
 
 		 496 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  47.76 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.11 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  49.11 
 
 		 525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  47.38 
 
 		 499 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  46.65 
 
 		 498 aa  442  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  47.38 
 
 		 499 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  45.75 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  46.31 
 
 		 496 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 504 aa  445  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  46.02 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  46.59 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  48.26 
 
 		 500 aa  438  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  45.82 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  46.02 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  46.02 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  46.02 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  45.92 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  46.02 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  46.87 
 
 		 505 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.28 
 
 		 492 aa  435  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  46.94 
 
 		 504 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  46.36 
 
 		 497 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  48.88 
 
 		 504 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  47.12 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.12 
 
 		 499 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  45.63 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  46.23 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  46.23 
 
 		 507 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  45.31 
 
 		 495 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  45.82 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  45.23 
 
 		 516 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  46.63 
 
 		 519 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  46.14 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  45.23 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  45.23 
 
 		 516 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  47.07 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>