More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1873 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3385  ABC transporter related  74.45 
 
 		 507 aa  767    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2649  ABC transporter related protein  70.95 
 
 		 518 aa  731    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.684281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1873  ABC transporter related  100 
 
 		 506 aa  1024    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0913  ribose ABC transporter ATP-binding protein  74.25 
 
 		 507 aa  766    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3251  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  74.65 
 
 		 507 aa  770    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4656  ABC transporter related  52.89 
 
 		 516 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489627  normal  0.659628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  52.5 
 
 		 525 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4757  ABC transporter related  52.5 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139896  normal  0.719575 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3768  ABC transporter related  51.3 
 
 		 514 aa  508  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3524  ABC transporter related  47.72 
 
 		 514 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3638  ABC transporter related  46.76 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1064  ABC transporter related  46.29 
 
 		 504 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0465117  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1851  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 512 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1961  ABC transporter related  45.15 
 
 		 512 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5321  ABC transporter related  45.53 
 
 		 514 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0567275  normal  0.751648 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0860  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2913  ABC transporter related  43.96 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762867  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0807  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.41753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0361  ABC transporter related  44.33 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  43.42 
 
 		 525 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  43.06 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  42.6 
 
 		 511 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  42.4 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  41.19 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  41.58 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.19 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.37 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  40.4 
 
 		 513 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  40.2 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 525 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  40.32 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  41.16 
 
 		 518 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  39.25 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  41.24 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 		 509 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.77 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.76 
 
 		 496 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  40.56 
 
 		 505 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  39.2 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.71 
 
 		 495 aa  364  2e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  39.96 
 
 		 524 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  39.96 
 
 		 524 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2803  ABC transporter related  42.02 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  40.61 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 501 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 507 aa  362  8e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  39.76 
 
 		 524 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  40.37 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  39.8 
 
 		 504 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  42.66 
 
 		 502 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 		 527 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  39.45 
 
 		 511 aa  360  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.07 
 
 		 507 aa  360  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 511 aa  359  7e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  38.97 
 
 		 501 aa  359  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.43 
 
 		 511 aa  359  8e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  40.08 
 
 		 524 aa  359  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  40.28 
 
 		 524 aa  359  8e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  40 
 
 		 528 aa  359  8e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  40.28 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  38.74 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2242  ABC transporter related  38.28 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  37.97 
 
 		 504 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  40.83 
 
 		 509 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 		 507 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.72 
 
 		 525 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  37.08 
 
 		 505 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  40.72 
 
 		 503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  40.83 
 
 		 520 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  41.13 
 
 		 523 aa  357  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  40.08 
 
 		 524 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0689  ABC transporter related  42.11 
 
 		 507 aa  357  3.9999999999999996e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.135079 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  39.12 
 
 		 495 aa  356  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3337  ABC transporter related  41.09 
 
 		 521 aa  356  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  40.24 
 
 		 501 aa  356  6.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  38.84 
 
 		 513 aa  355  7.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.41 
 
 		 506 aa  355  8.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 507 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  38.29 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  40.76 
 
 		 500 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  39.72 
 
 		 499 aa  355  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  38.92 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  38.92 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  39.72 
 
 		 499 aa  355  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  38.77 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  38.83 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  39.52 
 
 		 508 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  38.92 
 
 		 513 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  38.92 
 
 		 513 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  38.92 
 
 		 513 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  39.39 
 
 		 501 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.62 
 
 		 523 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  38.77 
 
 		 516 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  38.77 
 
 		 516 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.76 
 
 		 515 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.62 
 
 		 523 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  38.84 
 
 		 516 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  39.41 
 
 		 518 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  39.8 
 
 		 501 aa  353  5.9999999999999994e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>