More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1911 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  79.48 
 
 
504 aa  816    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  80.08 
 
 
523 aa  829    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  100 
 
 
506 aa  1035    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  79.48 
 
 
504 aa  816    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  80.08 
 
 
523 aa  829    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  84.62 
 
 
507 aa  880    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  80.08 
 
 
523 aa  829    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  89.66 
 
 
507 aa  921    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.68 
 
 
504 aa  816    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  80.76 
 
 
511 aa  830    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.68 
 
 
504 aa  816    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  79.48 
 
 
504 aa  816    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  84.81 
 
 
507 aa  881    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.68 
 
 
504 aa  818    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.48 
 
 
504 aa  816    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  78.47 
 
 
504 aa  808    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.48 
 
 
504 aa  816    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000458478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  79.48 
 
 
504 aa  816    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4140  L-arabinose transporter ATP-binding protein  58.12 
 
 
514 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  58.13 
 
 
507 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  57.93 
 
 
507 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  53.98 
 
 
511 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.09 
 
 
516 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429295  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3410  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.89 
 
 
512 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0659281  normal  0.140224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2614  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 
504 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383886  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.56 
 
 
511 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.58 
 
 
503 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0138907  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3704  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.18 
 
 
503 aa  548  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0139  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.58 
 
 
503 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.01 
 
 
519 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0622  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.58 
 
 
503 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0518663  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.26 
 
 
520 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0590  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.58 
 
 
503 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164103  normal  0.0495673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.18 
 
 
515 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 
522 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1180  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 
503 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.18 
 
 
515 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.18 
 
 
515 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3483  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 
503 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2763  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.71 
 
 
520 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691602  normal  0.315971 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 
503 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2757  L-arabinose transporter ATP-binding protein  53.54 
 
 
511 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  53.58 
 
 
515 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.31 
 
 
503 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  53.78 
 
 
525 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0405  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.31 
 
 
503 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1265  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.31 
 
 
503 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3447  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.31 
 
 
503 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3300  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.31 
 
 
503 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3776  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 
514 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.947339  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0523  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.24 
 
 
487 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431344  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4218  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.74 
 
 
520 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  0.845406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2599  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.02 
 
 
509 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1020  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 
497 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537406  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3009  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.43 
 
 
509 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  50 
 
 
508 aa  512  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3961  L-arabinose transporter ATP-binding protein  51.62 
 
 
515 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3764  L-arabinose transporter ATP-binding protein  49.5 
 
 
501 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.639409  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3476  L-arabinose transporter ATP-binding protein  48.69 
 
 
501 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  46.95 
 
 
494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  44.44 
 
 
513 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.62 
 
 
499 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
501 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  46.84 
 
 
500 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  45.25 
 
 
501 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  44.04 
 
 
513 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  43.06 
 
 
516 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.51 
 
 
524 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.51 
 
 
524 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 
523 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  45.56 
 
 
516 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.65 
 
 
527 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  42.65 
 
 
524 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  43.5 
 
 
495 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.31 
 
 
524 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.01 
 
 
515 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  43.27 
 
 
518 aa  425  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.11 
 
 
524 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  44.44 
 
 
514 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  45.17 
 
 
525 aa  422  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  44.93 
 
 
511 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  44.44 
 
 
514 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  42.65 
 
 
512 aa  425  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.11 
 
 
524 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  41.84 
 
 
515 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  44.44 
 
 
514 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.65 
 
 
520 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  45.62 
 
 
502 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  42.71 
 
 
498 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  44.65 
 
 
524 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
517 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  43.5 
 
 
494 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  43.84 
 
 
505 aa  420  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
500 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  44.51 
 
 
505 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  43.06 
 
 
513 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  44.81 
 
 
519 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.08 
 
 
495 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.62 
 
 
517 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.61 
 
 
506 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>