More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4757 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4656  ABC transporter related  93.8 
 
 
516 aa  978    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489627  normal  0.659628 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4757  ABC transporter related  100 
 
 
516 aa  1033    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139896  normal  0.719575 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3768  ABC transporter related  78.53 
 
 
514 aa  797    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  82.55 
 
 
525 aa  858    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1873  ABC transporter related  52.5 
 
 
506 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242655  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3251  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 
507 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3385  ABC transporter related  52.39 
 
 
507 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2649  ABC transporter related protein  52.98 
 
 
518 aa  510  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.684281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0913  ribose ABC transporter ATP-binding protein  52.19 
 
 
507 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1064  ABC transporter related  50.31 
 
 
504 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0465117  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5321  ABC transporter related  49.3 
 
 
514 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0567275  normal  0.751648 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3524  ABC transporter related  48.6 
 
 
514 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503605  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0860  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.92 
 
 
514 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2913  ABC transporter related  48.72 
 
 
514 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3638  ABC transporter related  48 
 
 
532 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0807  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.53 
 
 
514 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.41753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0361  ABC transporter related  49.5 
 
 
515 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1961  ABC transporter related  47.04 
 
 
512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1851  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.04 
 
 
512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  43.63 
 
 
501 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.85 
 
 
501 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  41.85 
 
 
501 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  41.85 
 
 
501 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  41.85 
 
 
501 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  41.85 
 
 
501 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  41.85 
 
 
501 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.05 
 
 
525 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  41.65 
 
 
501 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  41.68 
 
 
516 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  41.58 
 
 
501 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  41.68 
 
 
501 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  41.42 
 
 
504 aa  395  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  41.68 
 
 
516 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  41.68 
 
 
516 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  41.68 
 
 
516 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  41.65 
 
 
501 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  41.45 
 
 
525 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  40.81 
 
 
511 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  42.38 
 
 
514 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  40.57 
 
 
501 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  43.15 
 
 
495 aa  392  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
504 aa  388  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  41.9 
 
 
501 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  43.6 
 
 
502 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  44.85 
 
 
503 aa  389  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  40.57 
 
 
501 aa  388  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.37 
 
 
516 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  41.85 
 
 
501 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  41.05 
 
 
501 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  41.78 
 
 
504 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  42.25 
 
 
525 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  40.88 
 
 
501 aa  385  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  42.77 
 
 
528 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.16 
 
 
497 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  40.53 
 
 
494 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.57 
 
 
494 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  41.45 
 
 
501 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  38.14 
 
 
507 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  41.77 
 
 
518 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  39.4 
 
 
494 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  41.24 
 
 
512 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  41.97 
 
 
537 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  40.79 
 
 
513 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  41.42 
 
 
503 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  40.52 
 
 
499 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 
514 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  40.52 
 
 
499 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2972  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
515 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 
518 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1873  sugar transport ATP-binding protein  40.2 
 
 
515 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  40.99 
 
 
519 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  42.16 
 
 
495 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.36 
 
 
503 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 
501 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  40.69 
 
 
501 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.43 
 
 
501 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  42.31 
 
 
500 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3044  ABC transporter related  40.2 
 
 
515 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.43 
 
 
524 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  39.96 
 
 
520 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  39.96 
 
 
509 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  43.53 
 
 
514 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  40.59 
 
 
513 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.28 
 
 
510 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  40.97 
 
 
495 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.55 
 
 
499 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3337  ABC transporter related  41.14 
 
 
521 aa  372  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  38.24 
 
 
509 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  39.8 
 
 
513 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  41.29 
 
 
513 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  41.38 
 
 
500 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
528 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.16 
 
 
527 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  37.94 
 
 
513 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  39.96 
 
 
524 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  43.33 
 
 
514 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  40.56 
 
 
524 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  37.75 
 
 
513 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  38.83 
 
 
496 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  39.56 
 
 
501 aa  369  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>