More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0361 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0860  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  75.88 
 
 
514 aa  777    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1961  ABC transporter related  69.13 
 
 
512 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0361  ABC transporter related  100 
 
 
515 aa  1022    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5321  ABC transporter related  76.74 
 
 
514 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0567275  normal  0.751648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1851  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  69.13 
 
 
512 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0807  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  75.49 
 
 
514 aa  771    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.41753  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2913  ABC transporter related  77.09 
 
 
514 aa  783    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762867  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3768  ABC transporter related  50.6 
 
 
514 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4656  ABC transporter related  49.3 
 
 
516 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489627  normal  0.659628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  48.1 
 
 
525 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4757  ABC transporter related  49.5 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139896  normal  0.719575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2649  ABC transporter related protein  47.93 
 
 
518 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.684281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1064  ABC transporter related  49.19 
 
 
504 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0465117  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3524  ABC transporter related  46.41 
 
 
514 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0913  ribose ABC transporter ATP-binding protein  46.11 
 
 
507 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3385  ABC transporter related  45.91 
 
 
507 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3251  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
507 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3638  ABC transporter related  45.01 
 
 
532 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1873  ABC transporter related  44.33 
 
 
506 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242655  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  43.37 
 
 
511 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  41.97 
 
 
501 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2803  ABC transporter related  41.22 
 
 
501 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 
517 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.12 
 
 
496 aa  375  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  41.77 
 
 
500 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  43.72 
 
 
495 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  40.2 
 
 
507 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 
504 aa  372  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  40.8 
 
 
501 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  41.65 
 
 
501 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  41.95 
 
 
518 aa  369  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  41.9 
 
 
496 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  41.31 
 
 
501 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0227  ABC transporter related  41.19 
 
 
507 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  42.14 
 
 
504 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
501 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4627  ABC transporter related  43 
 
 
505 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.556183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  40.32 
 
 
501 aa  364  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  42.14 
 
 
495 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  40.85 
 
 
501 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  39.35 
 
 
494 aa  364  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  40.43 
 
 
516 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
504 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  40.59 
 
 
509 aa  363  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  40.85 
 
 
501 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  44.22 
 
 
525 aa  363  6e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  40.24 
 
 
511 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  41.4 
 
 
515 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  41.4 
 
 
515 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  40.43 
 
 
516 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2885  xylose transporter ATP-binding subunit  41.32 
 
 
518 aa  362  9e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700201  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  41.46 
 
 
505 aa  362  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 
516 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  40.43 
 
 
516 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.64 
 
 
501 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  40.64 
 
 
501 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 
501 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  41.24 
 
 
528 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  40.64 
 
 
501 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.82 
 
 
516 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 
501 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 
501 aa  361  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 
501 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  42.75 
 
 
499 aa  359  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  40.44 
 
 
501 aa  360  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  41.77 
 
 
499 aa  359  7e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  40.85 
 
 
501 aa  359  7e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  40.44 
 
 
501 aa  359  7e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.84 
 
 
497 aa  359  7e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  41.77 
 
 
499 aa  359  7e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  41.41 
 
 
509 aa  358  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  40.44 
 
 
501 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  39.88 
 
 
510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  43.52 
 
 
503 aa  355  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27960  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 
512 aa  355  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887259  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.96 
 
 
503 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  40.28 
 
 
505 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.97 
 
 
506 aa  355  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  42.34 
 
 
514 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.71 
 
 
501 aa  355  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  40.48 
 
 
495 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  41.6 
 
 
511 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.87 
 
 
494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.51 
 
 
501 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  40.24 
 
 
514 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 
494 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  42.25 
 
 
503 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  41.22 
 
 
537 aa  353  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  39.28 
 
 
494 aa  352  7e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  40.44 
 
 
501 aa  352  7e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  43.06 
 
 
504 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  41.94 
 
 
512 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  41.94 
 
 
512 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 
507 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
504 aa  351  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 
504 aa  351  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.2 
 
 
495 aa  351  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  37.47 
 
 
494 aa  351  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 
504 aa  351  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>