More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5684 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  95.53 
 
 		 516 aa  963    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  100 
 
 		 509 aa  1003    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  88.58 
 
 		 516 aa  885    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  80.43 
 
 		 511 aa  797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  63.73 
 
 		 498 aa  594  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  61.17 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  61.07 
 
 		 508 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  57.95 
 
 		 500 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  56.36 
 
 		 510 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 499 aa  499  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  51.21 
 
 		 505 aa  475  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  46.36 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 497 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  50.8 
 
 		 504 aa  464  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  49.9 
 
 		 501 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.59 
 
 		 525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  46.39 
 
 		 525 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 		 523 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  45.31 
 
 		 492 aa  451  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  47.06 
 
 		 495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  46.79 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  48.97 
 
 		 861 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  46.54 
 
 		 518 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 		 492 aa  444  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  45.14 
 
 		 497 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  46.8 
 
 		 515 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  43.99 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  45.29 
 
 		 494 aa  438  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  45.49 
 
 		 512 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  45.53 
 
 		 516 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  46.73 
 
 		 511 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  46.52 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  49.18 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  49.29 
 
 		 519 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 494 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  46.93 
 
 		 524 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  46.52 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  46.8 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  46.31 
 
 		 524 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  45.74 
 
 		 513 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  45.18 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.52 
 
 		 527 aa  435  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  46.31 
 
 		 524 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.36 
 
 		 507 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 		 494 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  45.18 
 
 		 513 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  45.56 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  45.36 
 
 		 507 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  46.52 
 
 		 524 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  44.7 
 
 		 511 aa  435  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  45.71 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  43.99 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  47.05 
 
 		 537 aa  428  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  43.58 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  45.7 
 
 		 503 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  45.64 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  46.12 
 
 		 511 aa  432  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  43.58 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 494 aa  428  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  46.22 
 
 		 524 aa  428  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  47.56 
 
 		 512 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  43.29 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.06 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  45.21 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.14 
 
 		 511 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 		 517 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.84 
 
 		 495 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 496 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  45.57 
 
 		 521 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  39.8 
 
 		 493 aa  420  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 		 508 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.76 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.76 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  43.64 
 
 		 506 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.56 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  45.12 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  44.92 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  46.22 
 
 		 517 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  41.67 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  43.79 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  43.27 
 
 		 500 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  43.97 
 
 		 494 aa  415  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  46.22 
 
 		 517 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  45.81 
 
 		 517 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.01 
 
 		 517 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  46.01 
 
 		 517 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  46.75 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  46.14 
 
 		 522 aa  413  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.51 
 
 		 517 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  46.01 
 
 		 517 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  46.61 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  42.36 
 
 		 516 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>