More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3041 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  100 
 
 
511 aa  1016    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  62.28 
 
 
507 aa  624  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  54.62 
 
 
509 aa  566  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  52.71 
 
 
513 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  52.91 
 
 
513 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  52.91 
 
 
513 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  53.11 
 
 
513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  52.91 
 
 
513 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  52.91 
 
 
513 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  52.8 
 
 
513 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  52.4 
 
 
513 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  52.71 
 
 
513 aa  560  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  52.51 
 
 
510 aa  554  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  52.51 
 
 
510 aa  554  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  50.9 
 
 
513 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  50.99 
 
 
513 aa  551  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0062  xylose transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 
513 aa  547  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0585  xylose transporter ATP-binding subunit  54.2 
 
 
504 aa  546  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0100  xylose transporter ATP-binding subunit  52.71 
 
 
513 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  53.57 
 
 
504 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  50.99 
 
 
514 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  52.6 
 
 
511 aa  535  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  51.39 
 
 
515 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  51.39 
 
 
515 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1151  xylose transporter ATP-binding subunit  52.4 
 
 
511 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  53.57 
 
 
509 aa  533  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  49.9 
 
 
519 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6737  xylose transporter ATP-binding subunit  49.9 
 
 
519 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.020966  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4210  xylose transporter ATP-binding subunit  49.61 
 
 
519 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2620  xylose transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 
519 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  49.9 
 
 
519 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  49.9 
 
 
525 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6035  xylose transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
519 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0730737  normal  0.8225 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6631  xylose transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 
519 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2885  xylose transporter ATP-binding subunit  50.5 
 
 
518 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700201  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
517 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  50.1 
 
 
518 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
517 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6335  xylose transporter ATP-binding subunit  48.72 
 
 
519 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2340  xylose transporter ATP-binding subunit  48.62 
 
 
519 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0775  xylose transporter ATP-binding subunit  50.8 
 
 
512 aa  510  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  51.49 
 
 
505 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  48.91 
 
 
524 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  49.6 
 
 
512 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  49.21 
 
 
512 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3905  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  48.91 
 
 
504 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.876803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  47.15 
 
 
521 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  48.62 
 
 
511 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  48.5 
 
 
512 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  50 
 
 
507 aa  472  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1104  ABC transporter related  49.4 
 
 
519 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2253  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000512006 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
529 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3073  ABC transporter related  46.91 
 
 
511 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.697432  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  47.7 
 
 
515 aa  465  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  49.9 
 
 
511 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1181  ABC transporter related  48.7 
 
 
520 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000288216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2138  L-arabinose transport ATP-binding protein araG  47.65 
 
 
516 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960653  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0878  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
529 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  47.25 
 
 
525 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  48.21 
 
 
507 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  48.8 
 
 
508 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3199  ABC transporter-related protein  46.41 
 
 
507 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.28101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2519  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
515 aa  462  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  45.98 
 
 
508 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  48.01 
 
 
511 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0738  ABC transporter related  45.42 
 
 
505 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  47.74 
 
 
512 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27960  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 
512 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887259  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2686  ABC transporter related  48.8 
 
 
516 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3402  ABC transporter related protein  45.18 
 
 
522 aa  458  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  46.41 
 
 
530 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 
515 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29470  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.63 
 
 
513 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2890  ABC transporter related protein  46.91 
 
 
516 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0580102  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.15 
 
 
497 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  47 
 
 
512 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  47.19 
 
 
516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  47.19 
 
 
516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  47.19 
 
 
501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.47 
 
 
515 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  47.19 
 
 
516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  47.19 
 
 
516 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.56 
 
 
506 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  45.56 
 
 
506 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.77 
 
 
506 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.38 
 
 
517 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 
506 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 
506 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  45.56 
 
 
506 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  48.31 
 
 
496 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0384  ABC transporter related  46.4 
 
 
509 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  46.2 
 
 
501 aa  443  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  44.05 
 
 
511 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 
506 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 
506 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.04 
 
 
501 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  47.04 
 
 
501 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  48.13 
 
 
500 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>