More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4100 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  78.74 
 
 		 513 aa  826    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  79.09 
 
 		 513 aa  830    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 510 aa  1040    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  78.54 
 
 		 513 aa  827    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  78.54 
 
 		 513 aa  826    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  78.35 
 
 		 513 aa  825    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0585  xylose transporter ATP-binding subunit  71.17 
 
 		 504 aa  747    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  78.54 
 
 		 513 aa  826    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  84.16 
 
 		 513 aa  869    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  83.37 
 
 		 513 aa  863    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0062  xylose transporter ATP-binding subunit  80.28 
 
 		 513 aa  835    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0100  xylose transporter ATP-binding subunit  83.66 
 
 		 513 aa  861    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  79.72 
 
 		 513 aa  840    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 510 aa  1040    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  78.74 
 
 		 513 aa  828    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  78.74 
 
 		 513 aa  827    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  57.8 
 
 		 509 aa  591  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1151  xylose transporter ATP-binding subunit  55.69 
 
 		 511 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038182  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  56.09 
 
 		 511 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  53.2 
 
 		 507 aa  568  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  52.47 
 
 		 515 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  52.47 
 
 		 515 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  52.78 
 
 		 514 aa  555  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  52.51 
 
 		 511 aa  554  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  53.68 
 
 		 525 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  54.38 
 
 		 519 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  54.58 
 
 		 519 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6737  xylose transporter ATP-binding subunit  54.58 
 
 		 519 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.020966  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 528 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2885  xylose transporter ATP-binding subunit  53.78 
 
 		 518 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700201  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2620  xylose transporter ATP-binding subunit  53.59 
 
 		 519 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4210  xylose transporter ATP-binding subunit  53.74 
 
 		 519 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  54.38 
 
 		 518 aa  545  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6631  xylose transporter ATP-binding subunit  53.39 
 
 		 519 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6335  xylose transporter ATP-binding subunit  54.09 
 
 		 519 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0775  xylose transporter ATP-binding subunit  52.68 
 
 		 512 aa  536  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2340  xylose transporter ATP-binding subunit  53.08 
 
 		 519 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6035  xylose transporter ATP-binding subunit  53.49 
 
 		 519 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0730737  normal  0.8225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  52.06 
 
 		 517 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  52.06 
 
 		 517 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  51.3 
 
 		 504 aa  519  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  48.72 
 
 		 509 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 		 505 aa  503  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  47.89 
 
 		 508 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 525 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  48.3 
 
 		 512 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  47.62 
 
 		 512 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  46.44 
 
 		 496 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2945  ABC transporter related  48.31 
 
 		 541 aa  462  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1181  ABC transporter related  48.01 
 
 		 520 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000288216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  47.34 
 
 		 512 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3073  ABC transporter related  46.84 
 
 		 511 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.697432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  47.22 
 
 		 512 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  47.09 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3905  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  46.51 
 
 		 504 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.876803  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  46.73 
 
 		 530 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1104  ABC transporter related  47.9 
 
 		 519 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296869  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  46.77 
 
 		 511 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 		 529 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0878  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 		 529 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2514  ABC transporter related protein  47.6 
 
 		 518 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  46.58 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  45.88 
 
 		 524 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  45.97 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  46.55 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2519  ABC transporter related protein  45.92 
 
 		 515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2138  L-arabinose transport ATP-binding protein araG  46.08 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2253  ABC transporter-related protein  47.02 
 
 		 505 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  44.88 
 
 		 511 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27960  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 512 aa  440  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  45.13 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29470  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 513 aa  438  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0738  ABC transporter related  45.83 
 
 		 505 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3199  ABC transporter-related protein  45.85 
 
 		 507 aa  438  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.28101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  45.17 
 
 		 494 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3402  ABC transporter related protein  46 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2686  ABC transporter related  44.93 
 
 		 516 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  47.02 
 
 		 507 aa  438  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0384  ABC transporter related  45.29 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  44.42 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  44.53 
 
 		 516 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44.73 
 
 		 497 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  44.53 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  45.45 
 
 		 507 aa  433  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  44.53 
 
 		 516 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  44.53 
 
 		 516 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  45.51 
 
 		 521 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  44.33 
 
 		 501 aa  435  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1860  xylose ABC transporter ATPase  43.68 
 
 		 517 aa  434  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.05268  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  44.53 
 
 		 516 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.74 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  43.74 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  43.74 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  43.74 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  43.74 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  46.14 
 
 		 513 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  43.74 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  43.94 
 
 		 501 aa  428  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  43.74 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  43.4 
 
 		 511 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>