More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4075 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  68.26 
 
 		 514 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1151  xylose transporter ATP-binding subunit  68.25 
 
 		 511 aa  692    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3004  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  68.32 
 
 		 528 aa  720    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2885  xylose transporter ATP-binding subunit  67.18 
 
 		 518 aa  725    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700201  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  69.34 
 
 		 518 aa  737    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2340  xylose transporter ATP-binding subunit  79.72 
 
 		 519 aa  816    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2620  xylose transporter ATP-binding subunit  82.35 
 
 		 519 aa  863    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  68.26 
 
 		 515 aa  716    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 517 aa  1041    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  80.71 
 
 		 519 aa  828    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  68.26 
 
 		 515 aa  716    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6335  xylose transporter ATP-binding subunit  81.6 
 
 		 519 aa  839    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4210  xylose transporter ATP-binding subunit  80.23 
 
 		 519 aa  830    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0775  xylose transporter ATP-binding subunit  64.06 
 
 		 512 aa  668    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  82.34 
 
 		 525 aa  845    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6737  xylose transporter ATP-binding subunit  80.71 
 
 		 519 aa  828    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.020966  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6631  xylose transporter ATP-binding subunit  82.16 
 
 		 519 aa  861    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 517 aa  1041    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6035  xylose transporter ATP-binding subunit  81.41 
 
 		 519 aa  838    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0730737  normal  0.8225 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6326  xylose transporter ATP-binding subunit  80.71 
 
 		 519 aa  827    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22602  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  69.25 
 
 		 511 aa  703    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  53.47 
 
 		 507 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  56.32 
 
 		 509 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  55.53 
 
 		 513 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  55.34 
 
 		 513 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  55.34 
 
 		 513 aa  551  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  55.34 
 
 		 513 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  55.14 
 
 		 513 aa  549  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  55.34 
 
 		 513 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0062  xylose transporter ATP-binding subunit  55.1 
 
 		 513 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  55.14 
 
 		 513 aa  548  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 		 513 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  54.18 
 
 		 513 aa  542  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  54.62 
 
 		 513 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  53.59 
 
 		 513 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  52.06 
 
 		 510 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  52.06 
 
 		 510 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0585  xylose transporter ATP-binding subunit  52.88 
 
 		 504 aa  524  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0100  xylose transporter ATP-binding subunit  52.79 
 
 		 513 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  50.5 
 
 		 504 aa  502  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  49.3 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  49 
 
 		 509 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 525 aa  462  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  48.82 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  49.01 
 
 		 512 aa  445  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27960  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 		 512 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  48.21 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2945  ABC transporter related  47.52 
 
 		 541 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29470  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.75 
 
 		 513 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  46.72 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  45.01 
 
 		 511 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2514  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 518 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0384  ABC transporter related  46.92 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  48.82 
 
 		 507 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1181  ABC transporter related  46.77 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000288216 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0405  ABC transporter related protein  46.53 
 
 		 514 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  46.92 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  46.25 
 
 		 515 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  46.12 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  45.4 
 
 		 508 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  46.14 
 
 		 497 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  47.64 
 
 		 511 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3073  ABC transporter related  45.06 
 
 		 511 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.697432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3402  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 522 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3905  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  45.11 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.876803  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  44.6 
 
 		 511 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.34 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  47.34 
 
 		 521 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  47.63 
 
 		 524 aa  418  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  43.91 
 
 		 495 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.53 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  45.53 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.71 
 
 		 529 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  44.05 
 
 		 512 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2997  ABC transporter related  45.73 
 
 		 519 aa  415  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.746869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  44.6 
 
 		 507 aa  414  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.02 
 
 		 517 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  45.53 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2686  ABC transporter related  44.23 
 
 		 516 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  43.9 
 
 		 512 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  43.14 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  45.53 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  43.6 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4718  ABC transporter related  46.83 
 
 		 564 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2519  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 515 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.75 
 
 		 496 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  45.53 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0878  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.71 
 
 		 529 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  43.94 
 
 		 495 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  44.93 
 
 		 516 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  45.13 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  43.96 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  44.93 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  45.53 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2253  ABC transporter-related protein  47.22 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3199  ABC transporter-related protein  46.84 
 
 		 507 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.28101 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  44.75 
 
 		 513 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2138  L-arabinose transport ATP-binding protein araG  45.91 
 
 		 516 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>