More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2519 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_27960  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  69.88 
 
 
512 aa  723    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887259  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  72.3 
 
 
512 aa  731    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2997  ABC transporter related  70.06 
 
 
519 aa  714    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.746869  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2945  ABC transporter related  72.58 
 
 
541 aa  738    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0405  ABC transporter related protein  67.13 
 
 
514 aa  681    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  62.85 
 
 
512 aa  659    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  69.35 
 
 
508 aa  725    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1181  ABC transporter related  65.61 
 
 
520 aa  666    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000288216 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  60.8 
 
 
511 aa  635    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1860  xylose ABC transporter ATPase  64.9 
 
 
517 aa  664    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.05268  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  61.57 
 
 
515 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2514  ABC transporter related protein  72.51 
 
 
518 aa  748    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  73.27 
 
 
508 aa  744    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1104  ABC transporter related  65.14 
 
 
519 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0384  ABC transporter related  67.46 
 
 
509 aa  674    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29470  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  67.18 
 
 
513 aa  682    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2519  ABC transporter related protein  100 
 
 
515 aa  1031    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4718  ABC transporter related  74.9 
 
 
564 aa  754    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  63.22 
 
 
521 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2686  ABC transporter related  60.44 
 
 
516 aa  631  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3402  ABC transporter related protein  61.68 
 
 
522 aa  624  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  60.84 
 
 
512 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  59.64 
 
 
512 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  59.24 
 
 
511 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2890  ABC transporter related protein  63.37 
 
 
516 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0580102  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3905  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  59.8 
 
 
504 aa  602  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.876803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3199  ABC transporter-related protein  61.8 
 
 
507 aa  600  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.28101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  60.6 
 
 
511 aa  598  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3073  ABC transporter related  59.24 
 
 
511 aa  596  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.697432  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  59.88 
 
 
524 aa  595  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  59.01 
 
 
530 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0257  ABC transporter related protein  61.34 
 
 
516 aa  592  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.391608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.42 
 
 
529 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  58.72 
 
 
513 aa  587  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0878  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.42 
 
 
529 aa  587  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  57.65 
 
 
512 aa  581  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2138  L-arabinose transport ATP-binding protein araG  57.83 
 
 
516 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960653  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2253  ABC transporter-related protein  58.63 
 
 
505 aa  568  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000512006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0738  ABC transporter related  58.03 
 
 
505 aa  561  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  57.72 
 
 
507 aa  556  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0757  ABC transporter related protein  57.11 
 
 
525 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0933075  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  51.68 
 
 
507 aa  528  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  47.72 
 
 
505 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  49.5 
 
 
504 aa  491  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  49.5 
 
 
507 aa  491  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  49.7 
 
 
513 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  49.5 
 
 
513 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  49.7 
 
 
513 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  49.7 
 
 
513 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  49.7 
 
 
513 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  49.7 
 
 
513 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  49.5 
 
 
513 aa  478  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  48.8 
 
 
513 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  47.91 
 
 
513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  47.91 
 
 
513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  49.7 
 
 
525 aa  465  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  47.04 
 
 
509 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0227  ABC transporter related  48.41 
 
 
507 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
511 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.69 
 
 
517 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0585  xylose transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 
513 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  45.92 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  45.92 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  46.78 
 
 
511 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1151  xylose transporter ATP-binding subunit  46.2 
 
 
511 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0100  xylose transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
513 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  48.11 
 
 
500 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0062  xylose transporter ATP-binding subunit  46 
 
 
513 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  44.6 
 
 
499 aa  428  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  43.63 
 
 
496 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  46.85 
 
 
514 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.97 
 
 
520 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  43.43 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 
525 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 
515 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 
517 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 
517 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 
515 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.14 
 
 
515 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 
509 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  46.35 
 
 
501 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  43.08 
 
 
500 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  43.96 
 
 
517 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  44.12 
 
 
505 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  45.96 
 
 
501 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.94 
 
 
512 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  44.27 
 
 
499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  43.16 
 
 
501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  42.03 
 
 
506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  46.44 
 
 
516 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  45.97 
 
 
514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6035  xylose transporter ATP-binding subunit  46.05 
 
 
519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0730737  normal  0.8225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0775  xylose transporter ATP-binding subunit  45.36 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  45.97 
 
 
514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.15 
 
 
514 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  44.75 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  44.27 
 
 
499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  43.82 
 
 
511 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>